Проблема в следующем:
@Theorem
some theorem
> a + b = c
Если перед > a + b = c необходимо делать отступ (как сейчас), то формула попадает внутрь окружения @Theorem. На данный момент такое можно решить только хаком:
@Theorem
Условие теоремы
%
> a + b = c
но это выглядит не очень. Также из-за этого есть ограничение на отступ ровно в два пробела в окружениях -- иначе не получается распарсить
@Theorem
> x = y
Условие теоремы
Если же убрать ограничение на отступ, то его можно будет делать по своему усмотрению и всё будет работать