From 2c768a37b10d24dc458af441f276092a77663a50 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Henrique Santos Date: Mon, 26 Feb 2024 14:34:02 -0500 Subject: [PATCH 01/46] first instances of study and cohort --- POEM-RCADS.rdf | 254 +++++++++++++++++++++++++++++++++++++++---------- 1 file changed, 204 insertions(+), 50 deletions(-) diff --git a/POEM-RCADS.rdf b/POEM-RCADS.rdf index cfa71b2..f6bf276 100644 --- a/POEM-RCADS.rdf +++ b/POEM-RCADS.rdf @@ -5,28 +5,36 @@ xmlns:owl="http://www.w3.org/2002/07/owl#" xmlns:rdf="http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#" xmlns:sir="http://purl.org/ontology/SIR#" + xmlns:swa="http://topbraid.org/swa#" xmlns:xml="http://www.w3.org/XML/1998/namespace" xmlns:xsd="http://www.w3.org/2001/XMLSchema#" xmlns:cito="http://purl.org/spar/cito/" + xmlns:dash="http://datashapes.org/dash#" xmlns:foaf="http://xmlns.com/foaf/0.1/" xmlns:poem="http://purl.org/ontology/POEM#" xmlns:prov="http://www.w3.org/ns/prov#" xmlns:rdfs="http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#" xmlns:skos="http://www.w3.org/2004/02/skos/core#" + xmlns:tosh="http://topbraid.org/tosh#" xmlns:vann="http://purl.org/vocab/vann/" xmlns:void="http://rdfs.org/ns/void#" xmlns:hasco="http://hadatac.org/ont/hasco/" + xmlns:model="http://edg.topbraid.solutions/model/" + xmlns:shacl="http://www.w3.org/ns/shacl#" xmlns:terms="http://purl.org/dc/terms/" xmlns:vstoi="http://hadatac.org/ont/vstoi#" xmlns:hasco1="http://www.semanticweb.org/kelsey/ontologies/2023/2/hasco#" xmlns:schema="http://schema.org/" xmlns:protege="http://protege.stanford.edu/plugins/owl/protege#" xmlns:elements="http://purl.org/ontology/SIR.org/dc/elements/1.1/" + xmlns:metadata="http://topbraid.org/metadata#" + xmlns:oboInOwl="http://www.geneontology.org/formats/oboInOwl#" xmlns:resource="http://semanticscience.org/resource/" xmlns:elements1="http://purl.org/ontology/POEM.org/dc/elements/1.1/" + xmlns:elements2="http://purl.org/twc/poem.org/dc/elements/1.1/" xmlns:ontodebug="http://ainf.aau.at/ontodebug#"> - + @@ -64,12 +72,54 @@ + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + @@ -299,6 +355,24 @@ + + + + + + + + + + + + + + + + + + @@ -308,6 +382,70 @@ + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 68 + + + + + + + + + + 12 + + + + + + + + + + 6 + + + + + + + + + + + + @@ -1912,14 +2050,30 @@ + + + + + + + + + + + + + + + + - es Me da miedo cuando tengo un examen. RCADS47Item7_es + @@ -1943,10 +2097,10 @@ - es Tengo problemas con mi apetito. RCADS47Item15_25Item10_es + @@ -1970,11 +2124,11 @@ - es Me preocupa que vaya a salir mal en mi trabajo de la escuela. RCADS47Item12_es + @@ -2028,10 +2182,10 @@ escuela. - es Me preocupo sobre las cosas. RCADS47Item1_es + @@ -2040,11 +2194,11 @@ escuela. - es Comienzo a temblar o a estremecerme aun cuando no hay razón alguna para sentirme así. RCADS47Item26_25Item14_es + @@ -2053,10 +2207,10 @@ razón alguna para sentirme así. - es Me preocupa hacer el ridículo. RCADS47Item20_es + @@ -2065,10 +2219,10 @@ razón alguna para sentirme así. - es Me da miedo el dormir solo/a. RCADS47Item17_25Item9_es + @@ -2077,11 +2231,11 @@ razón alguna para sentirme así. - es Tengo que pensar en pensamientos especiales (como números o palabras) para evitar que sucedan cosas malas. RCADS47Item31_25Item17_es + @@ -2090,11 +2244,11 @@ números o palabras) para evitar que sucedan cosas malas. - es De repente siento como si no pudiera respirar aun sin haber alguna razón para sentirme así. RCADS47Item14_es + @@ -2179,10 +2333,10 @@ alguna razón para sentirme así. - es No tengo energía para hacer las cosas. RCADS47Item19_25Item13_es + @@ -2221,10 +2375,10 @@ alguna razón para sentirme así. - es Estoy cansado/a con mucha frecuencia. RCADS47Item21_25Item21_es + @@ -2263,10 +2417,10 @@ alguna razón para sentirme así. - es Pienso acerca de la muerte. RCADS47Item37_25Item18_es + @@ -2290,10 +2444,10 @@ alguna razón para sentirme así. - es Me preocupa de que algo malo me vaya a suceder. RCADS47Item27_25Item25_es + @@ -2302,10 +2456,10 @@ alguna razón para sentirme así. - es Cuando tengo algún problema, me siento tembloroso/a. RCADS47Item28_es + @@ -2314,10 +2468,10 @@ alguna razón para sentirme así. - es Me preocupa el estar alejado/a de mis padres. RCADS47Item9_es + @@ -2326,11 +2480,11 @@ alguna razón para sentirme así. - es No parece que pueda quitarme los pensamientos malos o ridículos de la mente. RCADS47Item23_es + @@ -2370,10 +2524,10 @@ ridículos de la mente. - es Me preocupa cometer errores. RCADS47Item30_es + @@ -2382,11 +2536,11 @@ ridículos de la mente. - es Me siento de repente con mucho miedo sin haber alguna razón. RCADS47Item34_es + @@ -2440,12 +2594,12 @@ razón. - es Me da miedo estar en lugares concurridos (con mucha gente como en los centros comerciales, las películas, los autobuses, sitios de recreo llenos). RCADS47Item33_25Item6_es + @@ -2458,10 +2612,10 @@ autobuses, sitios de recreo llenos). - + en I worry what other people think of me. RCADS47Item32_25Item7 @@ -2481,10 +2635,10 @@ autobuses, sitios de recreo llenos). - es Cuando tengo algún problema, mi corazón late muy rápido. RCADS47Item24_es + @@ -2509,11 +2663,11 @@ autobuses, sitios de recreo llenos). - es Me siento con miedo si tengo que hablar en frente de la clase. RCADS47Item38_es + @@ -2538,10 +2692,10 @@ clase. - es Me preocupo cuando estoy en la cama en la noche. RCADS47Item45_es + @@ -2565,11 +2719,11 @@ clase. - es Me preocupa que algo terrible le vaya a pasar a alguien de mi familia. RCADS47Item13_25Item5_es + @@ -2639,10 +2793,10 @@ mi familia. - es Me preocupa lo que los demás piensen de mi . RCADS47Item32_25Item7_es + @@ -2651,10 +2805,10 @@ mi familia. - es Me siento como que no quiero moverme. RCADS47Item40_25Item19_es + @@ -2755,10 +2909,10 @@ mi familia. - es Me preocupa que me vayan a ocurrir cosas malas. RCADS47Item22_es + @@ -2812,10 +2966,10 @@ mi familia. - es Me preocupa de lo que vaya a pasar. RCADS47Item35_es + @@ -2824,10 +2978,10 @@ mi familia. - es Me da miedo tener que estar solo/a en casa. RCADS47Item5_25Item3_es + @@ -2836,10 +2990,10 @@ mi familia. - es Me preocupo cuando pienso que no hice algo bien. RCADS47Item4_25Item2_es + @@ -2864,10 +3018,10 @@ mi familia. - es Me daría miedo si tuviera que pasar la noche fuera de casa. RCADS47Item46_es + @@ -2876,11 +3030,11 @@ mi familia. - es Me molestan pensamientos malos o ridículos o imágenes en mi mente. RCADS47Item10_es + @@ -2889,10 +3043,10 @@ mi mente. - es Ya nada me divierte mucho. RCADS47Item6_25Item4_es + @@ -2931,10 +3085,10 @@ mi mente. - es Cuando tengo un problema, siento un malestar en el estómago. RCADS47Item3_es + @@ -2943,10 +3097,10 @@ mi mente. - es No puedo pensar con claridad. RCADS47Item25_25Item15_es + @@ -3000,10 +3154,10 @@ mi mente. - es Me siento inquieto/a. RCADS47Item47_25Item24_es + @@ -3027,11 +3181,11 @@ mi mente. - es Me preocupo cuando pienso que alguien está enojado/a conmigo. RCADS47Item8_es + @@ -3040,12 +3194,12 @@ conmigo. - es Tengo que verificar constantemente que haya hecho las cosas bien (como el apagar la luz, o que la puerta este cerrada con llave). RCADS47Item16_es + @@ -3054,11 +3208,11 @@ cerrada con llave). - es Tengo que hacer ciertas cosas una y otra vez (como lavarme las manos, limpiar, o poner las cosas en cierto orden). RCADS47Item42_25Item12_es + @@ -3082,11 +3236,11 @@ las manos, limpiar, o poner las cosas en cierto orden). - es Me late el corazón muy rápido aun cuando no hay razón para sentirme así. RCADS47Item39_es + @@ -3095,11 +3249,11 @@ para sentirme así. - es Me preocupo de que de repente vaya a sentir miedo aun cuando no hay razón para sentirme así. RCADS47Item41_25Item20_es + @@ -3123,11 +3277,11 @@ cuando no hay razón para sentirme así. - es Me cuesta trabajo ir a la escuela por las mañanas porque me siento nervioso/a o con miedo. RCADS47Item18_es + @@ -3136,10 +3290,10 @@ siento nervioso/a o con miedo. - es Tengo dificultades para dormir bien. RCADS47Item11_25Item8_es + @@ -3148,11 +3302,11 @@ siento nervioso/a o con miedo. - es Me da miedo que vaya a hacer el ridículo en frente de las personas. RCADS47Item43_25Item22_es + @@ -3176,10 +3330,10 @@ personas. - es Me siento que no valgo nada. RCADS47Item29_25Item16_es + @@ -3188,11 +3342,11 @@ personas. - es Tengo que hacer algunas cosas exactamente de la manera correcta para evitar que cosas malas sucedan. RCADS47Item44_25Item23_es + @@ -3201,11 +3355,11 @@ correcta para evitar que cosas malas sucedan. - es Me siento de repente mareado/a o débil aun cuando no haya razón para sentirme así. RCADS47Item36_25Item11_es + @@ -3214,10 +3368,10 @@ haya razón para sentirme así. - es Me siento triste o vacío/a. RCADS47Item2_25Item1_es + QuestionnaireItem SubClassOf Instrument @@ -3227,5 +3381,5 @@ haya razón para sentirme así. - + From 7fd880abecbd1411301c3584b0119dc1328955cc Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Kelsey Rook Date: Tue, 27 Feb 2024 14:35:58 -0500 Subject: [PATCH 02/46] Update POEM-RCADS.rdf Updated PURL, namespaces, imports to reflect current POEM version (cba5a0c) --- POEM-RCADS.rdf | 1879 ++++++++++++++++++++++++------------------------ 1 file changed, 938 insertions(+), 941 deletions(-) diff --git a/POEM-RCADS.rdf b/POEM-RCADS.rdf index f6bf276..98b74a3 100644 --- a/POEM-RCADS.rdf +++ b/POEM-RCADS.rdf @@ -1,17 +1,16 @@ - - + @@ -78,27 +75,27 @@ - + - + - + - + - + - + - + - + @@ -172,9 +169,9 @@ - + - + @@ -355,72 +352,72 @@ - + - + - + - + - + - + - + - + caregiver - + - + - + - + - + - + - - - + + + - + - + 68 - + - + 12 @@ -428,9 +425,9 @@ - + - + 6 @@ -438,1654 +435,1654 @@ - + - + - + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + - + - + - + - + - + es Me da miedo cuando tengo un examen. RCADS47Item7_es - + - + - + - - - - + + + + en I have no energy for things. RCADS47Item19_25Item13 @@ -2093,26 +2090,26 @@ - + - + es Tengo problemas con mi apetito. RCADS47Item15_25Item10_es - + - + - + - - - - + + + + en I think about death. RCADS47Item37_25Item18 @@ -2120,27 +2117,27 @@ - + - + es Me preocupa que vaya a salir mal en mi trabajo de la escuela. RCADS47Item12_es - + - + - + - - - - + + + + en My heart suddenly starts to beat too quickly for no reason. RCADS47Item39 @@ -2148,14 +2145,14 @@ escuela. - + - + - - - - + + + + en I can't seem to get bad or silly thoughts out of my head. RCADS47Item23 @@ -2163,14 +2160,14 @@ escuela. - + - + - - - - + + + + en I feel afraid that I will make a fool of myself in front of people. RCADS47Item43_25Item22 @@ -2178,89 +2175,89 @@ escuela. - + - + es Me preocupo sobre las cosas. RCADS47Item1_es - + - + - + es Comienzo a temblar o a estremecerme aun cuando no hay razón alguna para sentirme así. RCADS47Item26_25Item14_es - + - + - + es Me preocupa hacer el ridículo. RCADS47Item20_es - + - + - + es Me da miedo el dormir solo/a. RCADS47Item17_25Item9_es - + - + - + es Tengo que pensar en pensamientos especiales (como números o palabras) para evitar que sucedan cosas malas. RCADS47Item31_25Item17_es - + - + - + es De repente siento como si no pudiera respirar aun sin haber alguna razón para sentirme así. RCADS47Item14_es - + - + - + - - - - + + + + en When I have a problem, I feel shaky. RCADS47Item28 @@ -2268,14 +2265,14 @@ alguna razón para sentirme así. - + - + - - - - + + + + en No mapping in SNOMED exists to detected symptom (worry about future panic attacks) I worry that I will suddenly get a scared feeling when there is nothing to be afraid of. @@ -2284,14 +2281,14 @@ alguna razón para sentirme así. - + - + - - - - + + + + en I worry about being away from my parents. RCADS47Item9 @@ -2299,14 +2296,14 @@ alguna razón para sentirme así. - + - + - - - - + + + + en I get bothered by bad or silly thoughts or pictures in my mind. RCADS47Item10 @@ -2314,14 +2311,14 @@ alguna razón para sentirme así. - + - + - - - - + + + + en I suddenly feel as if I can't breathe when there is no reason for this. RCADS47Item14 @@ -2329,26 +2326,26 @@ alguna razón para sentirme así. - + - + es No tengo energía para hacer las cosas. RCADS47Item19_25Item13_es - + - + - + - - - - + + + + en When I have a problem, I get a funny feeling in my stomach. RCADS47Item3 @@ -2356,14 +2353,14 @@ alguna razón para sentirme así. - + - + - - - - + + + + en I feel like I don't want to move. RCADS47Item40_25Item19 @@ -2371,26 +2368,26 @@ alguna razón para sentirme así. - + - + es Estoy cansado/a con mucha frecuencia. RCADS47Item21_25Item21_es - + - + - + - - - - + + + + en I would feel scared if I had to stay away from home overnight. RCADS47Item46 @@ -2398,14 +2395,14 @@ alguna razón para sentirme así. - + - + - - - - + + + + en I feel restless. RCADS47Item47_25Item24 @@ -2413,26 +2410,26 @@ alguna razón para sentirme así. - + - + es Pienso acerca de la muerte. RCADS47Item37_25Item18_es - + - + - + - - - - + + + + en I suddenly start to tremble or shake when there is no reason for this. RCADS47Item26_25Item14 @@ -2440,63 +2437,63 @@ alguna razón para sentirme así. - + - + es Me preocupa de que algo malo me vaya a suceder. RCADS47Item27_25Item25_es - + - + - + es Cuando tengo algún problema, me siento tembloroso/a. RCADS47Item28_es - + - + - + es Me preocupa el estar alejado/a de mis padres. RCADS47Item9_es - + - + - + es No parece que pueda quitarme los pensamientos malos o ridículos de la mente. RCADS47Item23_es - + - + - + - - - - + + + + en I feel sad or empty. RCADS47Item2_25Item1 @@ -2504,14 +2501,14 @@ ridículos de la mente. - + - + - - - - + + + + en No exact mapping for detected symptom (worry about the future) exists in SNOMED I worry that something awful will happen to someone in my family. @@ -2520,39 +2517,39 @@ ridículos de la mente. - + - + es Me preocupa cometer errores. RCADS47Item30_es - + - + - + es Me siento de repente con mucho miedo sin haber alguna razón. RCADS47Item34_es - + - + - + - - - - + + + + en I suddenly become dizzy or faint when there is no reason for this. RCADS47Item36_25Item11 @@ -2560,14 +2557,14 @@ razón. - + - + - - - - + + + + en I feel scared if I have to sleep on my own. RCADS47Item17_25Item9 @@ -2575,14 +2572,14 @@ razón. - + - + - - - - + + + + en I worry about things. RCADS47Item1 @@ -2590,31 +2587,31 @@ razón. - + - + es Me da miedo estar en lugares concurridos (con mucha gente como en los centros comerciales, las películas, los autobuses, sitios de recreo llenos). RCADS47Item33_25Item6_es - + - + - + - - - - - - - + + + + + + + en I worry what other people think of me. @@ -2623,34 +2620,34 @@ autobuses, sitios de recreo llenos). - + - + - + - + es Cuando tengo algún problema, mi corazón late muy rápido. RCADS47Item24_es - + - + - + - - - - + + + + en I worry when I think I have done poorly at something. @@ -2659,27 +2656,27 @@ autobuses, sitios de recreo llenos). - + - + es Me siento con miedo si tengo que hablar en frente de la clase. RCADS47Item38_es - + - + - + - - - - + + + + en I worry about making mistakes. @@ -2688,26 +2685,26 @@ clase. - + - + es Me preocupo cuando estoy en la cama en la noche. RCADS47Item45_es - + - + - + - - - - + + + + en I feel worried when I think someone is angry with me. RCADS47Item8 @@ -2715,27 +2712,27 @@ clase. - + - + es Me preocupa que algo terrible le vaya a pasar a alguien de mi familia. RCADS47Item13_25Item5_es - + - + - + - - - - + + + + en I feel scared when I have to take a test. @@ -2744,14 +2741,14 @@ mi familia. - + - + - - - - + + + + en I would feel afraid of being on my own at home. RCADS47Item5_25Item3 @@ -2759,14 +2756,14 @@ mi familia. - + - + - - - - + + + + en I have trouble going to school in the mornings because I feel nervous or afraid. RCADS47Item18 @@ -2774,14 +2771,14 @@ mi familia. - + - + - - - - + + + + en Nothing is much fun anymore. RCADS47Item6_25Item4 @@ -2789,38 +2786,38 @@ mi familia. - + - + es Me preocupa lo que los demás piensen de mi . RCADS47Item32_25Item7_es - + - + - + es Me siento como que no quiero moverme. RCADS47Item40_25Item19_es - + - + - + - - - - + + + + en I have problems with my appetite. RCADS47Item15_25Item10 @@ -2828,14 +2825,14 @@ mi familia. - + - + - - - - + + + + en I have to do some things over and over again (like washing my hands, cleaning or putting things in a certain order). RCADS47Item42_25Item12 @@ -2843,14 +2840,14 @@ mi familia. - + - + - - - - + + + + en I worry that I will do badly at my schoolwork. @@ -2859,14 +2856,14 @@ mi familia. - + - + - - - - + + + + en No mapping in SNOMED exists to detected symptom (worry about sleep/reluctance to sleep) I worry when I go to bed at night. @@ -2875,14 +2872,14 @@ mi familia. - + - + - - - - + + + + en I worry about what is going to happen. RCADS47Item35 @@ -2890,14 +2887,14 @@ mi familia. - + - + - - - - + + + + en All of a sudden I feel really scared for no reason at all. RCADS47Item34 @@ -2905,26 +2902,26 @@ mi familia. - + - + es Me preocupa que me vayan a ocurrir cosas malas. RCADS47Item22_es - + - + - + - - - - + + + + en I have to do some things in just the right way to stop bad things from happening. RCADS47Item44_25Item23 @@ -2932,14 +2929,14 @@ mi familia. - + - + - - - - + + + + en I feel afraid if I have to talk in front of my class. RCADS47Item38 @@ -2947,14 +2944,14 @@ mi familia. - + - + - - - - + + + + en I feel worthless. RCADS47Item29_25Item16 @@ -2962,50 +2959,50 @@ mi familia. - + - + es Me preocupa de lo que vaya a pasar. RCADS47Item35_es - + - + - + es Me da miedo tener que estar solo/a en casa. RCADS47Item5_25Item3_es - + - + - + es Me preocupo cuando pienso que no hice algo bien. RCADS47Item4_25Item2_es - + - + - + - - - - + + + + en I worry I might look foolish. @@ -3014,51 +3011,51 @@ mi familia. - + - + es Me daría miedo si tuviera que pasar la noche fuera de casa. RCADS47Item46_es - + - + - + es Me molestan pensamientos malos o ridículos o imágenes en mi mente. RCADS47Item10_es - + - + - + es Ya nada me divierte mucho. RCADS47Item6_25Item4_es - + - + - + - - - - + + + + en I cannot think clearly. RCADS47Item25_25Item15 @@ -3066,14 +3063,14 @@ mi mente. - + - + - - - - + + + + en When I have a problem, my heart beats really fast. RCADS47Item24 @@ -3081,38 +3078,38 @@ mi mente. - + - + es Cuando tengo un problema, siento un malestar en el estómago. RCADS47Item3_es - + - + - + es No puedo pensar con claridad. RCADS47Item25_25Item15_es - + - + - + - - - - + + + + en I worry that something bad will happen to me. RCADS47Item27_25Item25 @@ -3120,14 +3117,14 @@ mi mente. - + - + - - - - + + + + en I am afraid of being in crowded places (like shopping centers, the movies, buses, busy playgrounds). RCADS47Item33_25Item6 @@ -3135,14 +3132,14 @@ mi mente. - + - + - - - - + + + + en I am tired a lot. RCADS47Item21_25Item21 @@ -3150,26 +3147,26 @@ mi mente. - + - + es Me siento inquieto/a. RCADS47Item47_25Item24_es - + - + - + - - - - + + + + en I have trouble sleeping. RCADS47Item11_25Item8 @@ -3177,54 +3174,54 @@ mi mente. - + - + es Me preocupo cuando pienso que alguien está enojado/a conmigo. RCADS47Item8_es - + - + - + es Tengo que verificar constantemente que haya hecho las cosas bien (como el apagar la luz, o que la puerta este cerrada con llave). RCADS47Item16_es - + - + - + es Tengo que hacer ciertas cosas una y otra vez (como lavarme las manos, limpiar, o poner las cosas en cierto orden). RCADS47Item42_25Item12_es - + - + - + - - - - + + + + en I have to think of special thoughts (like numbers or words) to stop bad things from happening. RCADS47Item31_25Item17 @@ -3232,40 +3229,40 @@ las manos, limpiar, o poner las cosas en cierto orden). - + - + es Me late el corazón muy rápido aun cuando no hay razón para sentirme así. RCADS47Item39_es - + - + - + es Me preocupo de que de repente vaya a sentir miedo aun cuando no hay razón para sentirme así. RCADS47Item41_25Item20_es - + - + - + - - - - + + + + en I have to keep checking that I have done things right (like the switch is off, or the door is locked). RCADS47Item16 @@ -3273,52 +3270,52 @@ cuando no hay razón para sentirme así. - + - + es Me cuesta trabajo ir a la escuela por las mañanas porque me siento nervioso/a o con miedo. RCADS47Item18_es - + - + - + es Tengo dificultades para dormir bien. RCADS47Item11_25Item8_es - + - + - + es Me da miedo que vaya a hacer el ridículo en frente de las personas. RCADS47Item43_25Item22_es - + - + - + - - - - + + + + en I worry that bad things will happen to me. RCADS47Item22 @@ -3326,52 +3323,52 @@ personas. - + - + es Me siento que no valgo nada. RCADS47Item29_25Item16_es - + - + - + es Tengo que hacer algunas cosas exactamente de la manera correcta para evitar que cosas malas sucedan. RCADS47Item44_25Item23_es - + - + - + es Me siento de repente mareado/a o débil aun cuando no haya razón para sentirme así. RCADS47Item36_25Item11_es - + - + - + es Me siento triste o vacío/a. RCADS47Item2_25Item1_es - + QuestionnaireItem SubClassOf Instrument From e645d45f9c62f94138917682a73b0e2fc5c10d81 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Kelsey Rook Date: Thu, 29 Feb 2024 23:29:01 -0500 Subject: [PATCH 03/46] Update POEM-RCADS.rdf Added cohort/study, evidence modelling example --- POEM-RCADS.rdf | 209 +++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++---- 1 file changed, 194 insertions(+), 15 deletions(-) diff --git a/POEM-RCADS.rdf b/POEM-RCADS.rdf index 98b74a3..407ac20 100644 --- a/POEM-RCADS.rdf +++ b/POEM-RCADS.rdf @@ -25,10 +25,10 @@ xmlns:hasco1="http://www.semanticweb.org/kelsey/ontologies/2023/2/hasco#" xmlns:schema="http://schema.org/" xmlns:protege="http://protege.stanford.edu/plugins/owl/protege#" + xmlns:elements="http://purl.org/twc/poem.org/dc/elements/1.1/" xmlns:metadata="http://topbraid.org/metadata#" xmlns:oboInOwl="http://www.geneontology.org/formats/oboInOwl#" xmlns:resource="http://semanticscience.org/resource/" - xmlns:elements="http://purl.org/twc/poem.org/dc/elements/1.1/" xmlns:ontodebug="http://ainf.aau.at/ontodebug#"> @@ -99,6 +99,12 @@ + + + + + + @@ -140,6 +146,14 @@ + + + + has finding + + + + @@ -169,12 +183,26 @@ + + + + + + + + + + finding + + + + @@ -352,6 +380,12 @@ + + + + + + @@ -395,13 +429,26 @@ - + + + + + + + + + + + + + - + + @@ -435,6 +482,124 @@ + + + + + + + + + + + + + + + + 0.77 + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 0.81 + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 0.84 + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 0.71 + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 0.76 + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 0.66 + + + + @@ -447,6 +612,9 @@ + + + @@ -474,9 +642,6 @@ - - - @@ -1989,6 +2154,13 @@ + + + + + + + @@ -2036,13 +2208,6 @@ - - - - - - - @@ -2609,10 +2774,10 @@ autobuses, sitios de recreo llenos). + - en I worry what other people think of me. RCADS47Item32_25Item7 @@ -3374,9 +3539,23 @@ haya razón para sentirme así. QuestionnaireItem SubClassOf Instrument false + + + + + + + Pearson's correlation coefficient + - + From 50addb075cab97b76c85d577b507063d86c41891 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Kelsey Rook Date: Thu, 7 Mar 2024 13:21:40 -0500 Subject: [PATCH 04/46] Added p-values, readable labels to findings --- POEM-RCADS.rdf | 161 +++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++---- 1 file changed, 150 insertions(+), 11 deletions(-) diff --git a/POEM-RCADS.rdf b/POEM-RCADS.rdf index 407ac20..588925c 100644 --- a/POEM-RCADS.rdf +++ b/POEM-RCADS.rdf @@ -29,7 +29,8 @@ xmlns:metadata="http://topbraid.org/metadata#" xmlns:oboInOwl="http://www.geneontology.org/formats/oboInOwl#" xmlns:resource="http://semanticscience.org/resource/" - xmlns:ontodebug="http://ainf.aau.at/ontodebug#"> + xmlns:ontodebug="http://ainf.aau.at/ontodebug#" + xmlns:poem-rcads="http://purl.org/twc/poem-rcads#"> @@ -105,6 +106,18 @@ + + + + + + + + + + + + @@ -154,6 +167,24 @@ + + + + + has statistic + + + + + + + + + is statistic about + + + + @@ -183,6 +214,14 @@ + + + + p-value + + + + @@ -417,6 +456,7 @@ + Chorpita Full Study 1 @@ -425,6 +465,7 @@ + Chorpita Full Study 2 @@ -437,6 +478,7 @@ + Chorpita Study 2 @@ -449,6 +491,7 @@ + Chorpita Full Study 2 Age 6-12 Cohort @@ -458,6 +501,7 @@ 68 + Chorpita Full Study 2 Age 6-12 Cohort count @@ -468,6 +512,7 @@ 12 + Chorpita Full Study 2 Age 6-12 Cohort max age @@ -478,6 +523,7 @@ 6 + Chorpita Full Study 2 Age 6-12 Cohort min age @@ -486,8 +532,22 @@ + + + Chorpita Full Study 2 Age 6-12 SP Finding + + + + + + + + + + 0.01 + Chorpita Full Study 2 Age 6-12 SP p-value @@ -496,8 +556,9 @@ - + 0.77 + Chorpita Full Study 2 Age 6-12 SP r-value @@ -506,18 +567,33 @@ + + + Chorpita Full Study 2 Age 6-12 PD Finding + + + + + + + 0.01 + Chorpita Full Study 2 Age 6-12 PD p-value + + - + + - + 0.81 + Chorpita Full Study 2 Age 6-12 PD r-value @@ -526,37 +602,68 @@ + + + Chorpita Full Study 2 Age 6-12 GAD Finding + + + + + + + + + + 0.01 + Chorpita Full Study 2 Age 6-12 GAD p-value - + - + 0.84 + Chorpita Full Study 2 Age 6-12 GAD r-value + + + + Chorpita Full Study 2 Age 6-12 MDD Finding + + - + + + + 0.01 + Chorpita Full Study 2 Age 6-12 MDD p-value + + + + + - + 0.71 + Chorpita Full Study 2 Age 6-12 MDD r-value @@ -565,8 +672,22 @@ + + + Chorpita Full Study 2 Age 6-12 SAD Finding + + + + + + + + + + 0.01 + Chorpita Full Study 2 Age 6-12 SAD p-value @@ -575,27 +696,44 @@ - + 0.76 + Chorpita Full Study 2 Age 6-12 SAD r-value + + + + Chorpita Full Study 2 Age 6-12 OCD Finding + + + + + + + + 0.01 + Chorpita Full Study 2 Age 6-12 OCD p-value + + - + - + 0.66 + Chorpita Full Study 2 Age 6-12 OCD r-value @@ -604,6 +742,7 @@ + Chorpita Full Study 2 Age 6-12 Girls Cohort From 3c2daa85acbce09a37afbc491cceb9f11093d3d5 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Kelsey Rook Date: Thu, 7 Mar 2024 14:27:25 -0500 Subject: [PATCH 05/46] Added axioms on Finding --- POEM-RCADS.rdf | 77 +++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++----- 1 file changed, 70 insertions(+), 7 deletions(-) diff --git a/POEM-RCADS.rdf b/POEM-RCADS.rdf index 588925c..48a5cf5 100644 --- a/POEM-RCADS.rdf +++ b/POEM-RCADS.rdf @@ -112,12 +112,6 @@ - - - - - - @@ -191,6 +185,26 @@ + + + + + + + + + + is significant + + + + + + + + item + + + + @@ -214,9 +237,18 @@ + + + + data item + + + + + p-value @@ -224,7 +256,9 @@ - + + + @@ -237,6 +271,33 @@ + + + + + + + + + + 1 + + + + + + + + + + + + + + 1 + + + finding @@ -2355,6 +2416,7 @@ + Chorpita Original Study 1 @@ -2363,6 +2425,7 @@ + Chorpita Original Study 2 From 643f06478631817c418bbf9e20efbe33c75d7b26 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Kelsey Rook Date: Thu, 7 Mar 2024 14:36:02 -0500 Subject: [PATCH 06/46] Added 'is significant' for Findings --- POEM-RCADS.rdf | 6 ++++++ 1 file changed, 6 insertions(+) diff --git a/POEM-RCADS.rdf b/POEM-RCADS.rdf index 48a5cf5..3a3177d 100644 --- a/POEM-RCADS.rdf +++ b/POEM-RCADS.rdf @@ -596,6 +596,7 @@ + true Chorpita Full Study 2 Age 6-12 SP Finding @@ -631,6 +632,7 @@ + true Chorpita Full Study 2 Age 6-12 PD Finding @@ -666,6 +668,7 @@ + true Chorpita Full Study 2 Age 6-12 GAD Finding @@ -701,6 +704,7 @@ + true Chorpita Full Study 2 Age 6-12 MDD Finding @@ -736,6 +740,7 @@ + true Chorpita Full Study 2 Age 6-12 SAD Finding @@ -771,6 +776,7 @@ + true Chorpita Full Study 2 Age 6-12 OCD Finding From 5d8107fcd63941d00fa2d30c39ca8d9e2314012c Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Kelsey Rook Date: Fri, 15 Mar 2024 01:19:16 -0400 Subject: [PATCH 07/46] Update POEM-RCADS.rdf for evidence modeling Findings -> Evidence (ECO) Added isAboutTarget, isAboutSource for modelling correlation --- POEM-RCADS.rdf | 189 +++++++++++++------------------------------------ 1 file changed, 49 insertions(+), 140 deletions(-) diff --git a/POEM-RCADS.rdf b/POEM-RCADS.rdf index 3a3177d..1c00240 100644 --- a/POEM-RCADS.rdf +++ b/POEM-RCADS.rdf @@ -161,20 +161,20 @@ - + - - - has statistic + + + is about source - + - - - is statistic about + + + is about target @@ -237,6 +237,14 @@ + + + + evidence + + + + @@ -268,41 +276,6 @@ - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - finding - - - - @@ -572,6 +545,7 @@ + 12 Chorpita Full Study 2 Age 6-12 Cohort max age @@ -583,31 +557,19 @@ + 6 Chorpita Full Study 2 Age 6-12 Cohort min age - - - - - - - - true - - Chorpita Full Study 2 Age 6-12 SP Finding - - - - + - + 0.01 Chorpita Full Study 2 Age 6-12 SP p-value @@ -617,33 +579,22 @@ + - + + 0.77 Chorpita Full Study 2 Age 6-12 SP r-value - - - - - - - - true - - Chorpita Full Study 2 Age 6-12 PD Finding - - - - + - + 0.01 Chorpita Full Study 2 Age 6-12 PD p-value @@ -653,33 +604,22 @@ + - + + 0.81 Chorpita Full Study 2 Age 6-12 PD r-value - - - - - - - - true - - Chorpita Full Study 2 Age 6-12 GAD Finding - - - - + - + 0.01 Chorpita Full Study 2 Age 6-12 GAD p-value @@ -689,33 +629,22 @@ + - + + 0.84 Chorpita Full Study 2 Age 6-12 GAD r-value - - - - - - - - true - - Chorpita Full Study 2 Age 6-12 MDD Finding - - - - + - + 0.01 Chorpita Full Study 2 Age 6-12 MDD p-value @@ -725,33 +654,22 @@ + - + + 0.71 Chorpita Full Study 2 Age 6-12 MDD r-value - - - - - - - - true - - Chorpita Full Study 2 Age 6-12 SAD Finding - - - - + - + 0.01 Chorpita Full Study 2 Age 6-12 SAD p-value @@ -761,33 +679,22 @@ + - + + 0.76 Chorpita Full Study 2 Age 6-12 SAD r-value - - - - - - - - true - - Chorpita Full Study 2 Age 6-12 OCD Finding - - - - + - + 0.01 Chorpita Full Study 2 Age 6-12 OCD p-value @@ -797,8 +704,10 @@ + - + + 0.66 Chorpita Full Study 2 Age 6-12 OCD r-value @@ -3765,5 +3674,5 @@ haya razón para sentirme así. - + From 0f60931253182662a3810fcb1d42ac2e5ed7d67a Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: shmewtep Date: Tue, 19 Mar 2024 13:36:51 -0400 Subject: [PATCH 08/46] Moved new POEM evidence modeling classes from POEM-RCADS to POEM --- POEM-RCADS.rdf | 99 -------------------------------------------------- POEM.rdf | 95 +++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++- 2 files changed, 94 insertions(+), 100 deletions(-) diff --git a/POEM-RCADS.rdf b/POEM-RCADS.rdf index 1c00240..1bc989d 100644 --- a/POEM-RCADS.rdf +++ b/POEM-RCADS.rdf @@ -151,31 +151,6 @@ - - - - - - has finding - - - - - - - - - is about source - - - - - - - - - is about target - @@ -194,14 +169,6 @@ --> - - - - - - - is significant - @@ -216,72 +183,6 @@ - - - - - item - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - evidence - - - - - - - - data item - - - - - - - - - p-value - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + + + + is about source + + + + + + + + + is about target + + + + @@ -286,6 +304,26 @@ + + + + + + + + + + is significant + + + + + + + + item + + + + + + + + + + + + + + + + @@ -533,6 +592,40 @@ + + + + evidence + + + + + + + + data item + + + + + + + + + p-value + + + + + + + + + Pearson's correlation coefficient + + + + @@ -1125,5 +1218,5 @@ - + From 20de029351bdc472e6b7ff3996734461b7a25c7c Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Kelsey Rook Date: Tue, 19 Mar 2024 14:14:09 -0400 Subject: [PATCH 09/46] Removed redundant class declarations --- POEM-RCADS.rdf | 4 ---- 1 file changed, 4 deletions(-) diff --git a/POEM-RCADS.rdf b/POEM-RCADS.rdf index 1bc989d..8b7c94a 100644 --- a/POEM-RCADS.rdf +++ b/POEM-RCADS.rdf @@ -3567,10 +3567,6 @@ haya razón para sentirme así. // /////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////// --> - - - Pearson's correlation coefficient - From 023ece8e096378a057d8ef3004c20103a624b703 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Kelsey Rook Date: Tue, 19 Mar 2024 14:18:27 -0400 Subject: [PATCH 10/46] Added several labels/definitions --- POEM.rdf | 9 ++++++--- 1 file changed, 6 insertions(+), 3 deletions(-) diff --git a/POEM.rdf b/POEM.rdf index b0e5e06..9ffb331 100644 --- a/POEM.rdf +++ b/POEM.rdf @@ -358,13 +358,16 @@ - - + questionnaire item + - + + response option + From 5df9d6768d997c0a26b7fca475371bbb9b55f98d Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Kelsey Rook Date: Tue, 19 Mar 2024 14:20:48 -0400 Subject: [PATCH 11/46] small error fix --- POEM.rdf | 2 +- 1 file changed, 1 insertion(+), 1 deletion(-) diff --git a/POEM.rdf b/POEM.rdf index 9ffb331..411f704 100644 --- a/POEM.rdf +++ b/POEM.rdf @@ -358,7 +358,7 @@ - questionnaire item From d54d468e45a7d4101d597ab31835d2f6de37a333 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Kelsey Rook Date: Fri, 29 Mar 2024 13:21:44 -0400 Subject: [PATCH 12/46] Added STATO and ECO prefixes --- POEM.rdf | 2 ++ 1 file changed, 2 insertions(+) diff --git a/POEM.rdf b/POEM.rdf index 411f704..45d77f1 100644 --- a/POEM.rdf +++ b/POEM.rdf @@ -2,6 +2,7 @@ Date: Mon, 15 Apr 2024 19:08:38 -0400 Subject: [PATCH 13/46] Removed ontodebug statements QuestionnaireItem was included in a ontodebug statement, rather than imported from VSTO-I; not sure how this happened --- POEM-RCADS.rdf | 28 ---------------------------- 1 file changed, 28 deletions(-) diff --git a/POEM-RCADS.rdf b/POEM-RCADS.rdf index 8b7c94a..c25aeea 100644 --- a/POEM-RCADS.rdf +++ b/POEM-RCADS.rdf @@ -29,7 +29,6 @@ xmlns:metadata="http://topbraid.org/metadata#" xmlns:oboInOwl="http://www.geneontology.org/formats/oboInOwl#" xmlns:resource="http://semanticscience.org/resource/" - xmlns:ontodebug="http://ainf.aau.at/ontodebug#" xmlns:poem-rcads="http://purl.org/twc/poem-rcads#"> @@ -47,29 +46,6 @@ - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - @@ -3553,10 +3529,6 @@ haya razón para sentirme así. RCADS47Item2_25Item1_es - - QuestionnaireItem SubClassOf Instrument - false - From 94335f5f5b72945413e577e007b7762a02f0d4f5 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Kelsey Rook Date: Wed, 17 Apr 2024 14:19:05 -0400 Subject: [PATCH 14/46] re-added hasLanguage data property --- POEM.rdf | 8 +++++++- 1 file changed, 7 insertions(+), 1 deletion(-) diff --git a/POEM.rdf b/POEM.rdf index 45d77f1..d9373cc 100644 --- a/POEM.rdf +++ b/POEM.rdf @@ -314,7 +314,13 @@ /////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////// --> - + + + + + + has language + From 90e7ee634f56d54db23ab1eae7ec6fc1c8d700e6 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: shmewtep Date: Wed, 17 Apr 2024 15:45:04 -0400 Subject: [PATCH 15/46] fixed VSTO-I data properties that were mistakenly declared as annotation properties in POEM --- POEM-RCADS.rdf | 229 +++++++++++++++++++++---------------------------- POEM.rdf | 43 ++++++---- 2 files changed, 126 insertions(+), 146 deletions(-) diff --git a/POEM-RCADS.rdf b/POEM-RCADS.rdf index c25aeea..63df47d 100644 --- a/POEM-RCADS.rdf +++ b/POEM-RCADS.rdf @@ -22,7 +22,6 @@ xmlns:shacl="http://www.w3.org/ns/shacl#" xmlns:terms="http://purl.org/dc/terms/" xmlns:vstoi="http://hadatac.org/ont/vstoi#" - xmlns:hasco1="http://www.semanticweb.org/kelsey/ontologies/2023/2/hasco#" xmlns:schema="http://schema.org/" xmlns:protege="http://protege.stanford.edu/plugins/owl/protege#" xmlns:elements="http://purl.org/twc/poem.org/dc/elements/1.1/" @@ -31,7 +30,7 @@ xmlns:resource="http://semanticscience.org/resource/" xmlns:poem-rcads="http://purl.org/twc/poem-rcads#"> - + @@ -43,36 +42,6 @@ // /////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////// --> - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - @@ -86,11 +55,6 @@ - - - - - @@ -2226,7 +2190,7 @@ - es + es Me da miedo cuando tengo un examen. RCADS47Item7_es @@ -2242,7 +2206,7 @@ - en + en I have no energy for things. RCADS47Item19_25Item13 @@ -2253,7 +2217,7 @@ - es + es Tengo problemas con mi apetito. RCADS47Item15_25Item10_es @@ -2269,7 +2233,7 @@ - en + en I think about death. RCADS47Item37_25Item18 @@ -2280,7 +2244,7 @@ - es + es Me preocupa que vaya a salir mal en mi trabajo de la escuela. RCADS47Item12_es @@ -2297,7 +2261,7 @@ escuela. - en + en My heart suddenly starts to beat too quickly for no reason. RCADS47Item39 @@ -2312,7 +2276,7 @@ escuela. - en + en I can't seem to get bad or silly thoughts out of my head. RCADS47Item23 @@ -2327,7 +2291,7 @@ escuela. - en + en I feel afraid that I will make a fool of myself in front of people. RCADS47Item43_25Item22 @@ -2338,7 +2302,7 @@ escuela. - es + es Me preocupo sobre las cosas. RCADS47Item1_es @@ -2350,7 +2314,7 @@ escuela. - es + es Comienzo a temblar o a estremecerme aun cuando no hay razón alguna para sentirme así. RCADS47Item26_25Item14_es @@ -2363,7 +2327,7 @@ razón alguna para sentirme así. - es + es Me preocupa hacer el ridículo. RCADS47Item20_es @@ -2375,7 +2339,7 @@ razón alguna para sentirme así. - es + es Me da miedo el dormir solo/a. RCADS47Item17_25Item9_es @@ -2387,7 +2351,7 @@ razón alguna para sentirme así. - es + es Tengo que pensar en pensamientos especiales (como números o palabras) para evitar que sucedan cosas malas. RCADS47Item31_25Item17_es @@ -2400,7 +2364,7 @@ números o palabras) para evitar que sucedan cosas malas. - es + es De repente siento como si no pudiera respirar aun sin haber alguna razón para sentirme así. RCADS47Item14_es @@ -2417,7 +2381,7 @@ alguna razón para sentirme así. - en + en When I have a problem, I feel shaky. RCADS47Item28 @@ -2432,7 +2396,7 @@ alguna razón para sentirme así. - en + en No mapping in SNOMED exists to detected symptom (worry about future panic attacks) I worry that I will suddenly get a scared feeling when there is nothing to be afraid of. RCADS47Item41_25Item20 @@ -2448,7 +2412,7 @@ alguna razón para sentirme así. - en + en I worry about being away from my parents. RCADS47Item9 @@ -2463,7 +2427,7 @@ alguna razón para sentirme así. - en + en I get bothered by bad or silly thoughts or pictures in my mind. RCADS47Item10 @@ -2478,7 +2442,7 @@ alguna razón para sentirme así. - en + en I suddenly feel as if I can't breathe when there is no reason for this. RCADS47Item14 @@ -2489,7 +2453,7 @@ alguna razón para sentirme así. - es + es No tengo energía para hacer las cosas. RCADS47Item19_25Item13_es @@ -2505,7 +2469,7 @@ alguna razón para sentirme así. - en + en When I have a problem, I get a funny feeling in my stomach. RCADS47Item3 @@ -2520,7 +2484,7 @@ alguna razón para sentirme así. - en + en I feel like I don't want to move. RCADS47Item40_25Item19 @@ -2531,7 +2495,7 @@ alguna razón para sentirme así. - es + es Estoy cansado/a con mucha frecuencia. RCADS47Item21_25Item21_es @@ -2547,7 +2511,7 @@ alguna razón para sentirme así. - en + en I would feel scared if I had to stay away from home overnight. RCADS47Item46 @@ -2562,7 +2526,7 @@ alguna razón para sentirme así. - en + en I feel restless. RCADS47Item47_25Item24 @@ -2573,7 +2537,7 @@ alguna razón para sentirme así. - es + es Pienso acerca de la muerte. RCADS47Item37_25Item18_es @@ -2589,7 +2553,7 @@ alguna razón para sentirme así. - en + en I suddenly start to tremble or shake when there is no reason for this. RCADS47Item26_25Item14 @@ -2600,7 +2564,7 @@ alguna razón para sentirme así. - es + es Me preocupa de que algo malo me vaya a suceder. RCADS47Item27_25Item25_es @@ -2612,7 +2576,7 @@ alguna razón para sentirme así. - es + es Cuando tengo algún problema, me siento tembloroso/a. RCADS47Item28_es @@ -2624,7 +2588,7 @@ alguna razón para sentirme así. - es + es Me preocupa el estar alejado/a de mis padres. RCADS47Item9_es @@ -2636,7 +2600,7 @@ alguna razón para sentirme así. - es + es No parece que pueda quitarme los pensamientos malos o ridículos de la mente. RCADS47Item23_es @@ -2653,7 +2617,7 @@ ridículos de la mente. - en + en I feel sad or empty. RCADS47Item2_25Item1 @@ -2668,7 +2632,7 @@ ridículos de la mente. - en + en No exact mapping for detected symptom (worry about the future) exists in SNOMED I worry that something awful will happen to someone in my family. RCADS47Item13_25Item5 @@ -2680,7 +2644,7 @@ ridículos de la mente. - es + es Me preocupa cometer errores. RCADS47Item30_es @@ -2692,7 +2656,7 @@ ridículos de la mente. - es + es Me siento de repente con mucho miedo sin haber alguna razón. RCADS47Item34_es @@ -2709,7 +2673,7 @@ razón. - en + en I suddenly become dizzy or faint when there is no reason for this. RCADS47Item36_25Item11 @@ -2724,7 +2688,7 @@ razón. - en + en I feel scared if I have to sleep on my own. RCADS47Item17_25Item9 @@ -2739,7 +2703,7 @@ razón. - en + en I worry about things. RCADS47Item1 @@ -2750,7 +2714,7 @@ razón. - es + es Me da miedo estar en lugares concurridos (con mucha gente como en los centros comerciales, las películas, los autobuses, sitios de recreo llenos). @@ -2772,7 +2736,7 @@ autobuses, sitios de recreo llenos). - en + en I worry what other people think of me. RCADS47Item32_25Item7 @@ -2791,7 +2755,7 @@ autobuses, sitios de recreo llenos). - es + es Cuando tengo algún problema, mi corazón late muy rápido. RCADS47Item24_es @@ -2808,7 +2772,7 @@ autobuses, sitios de recreo llenos). - en + en I worry when I think I have done poorly at something. RCADS47Item4_25Item2 @@ -2819,7 +2783,7 @@ autobuses, sitios de recreo llenos). - es + es Me siento con miedo si tengo que hablar en frente de la clase. RCADS47Item38_es @@ -2837,7 +2801,7 @@ clase. - en + en I worry about making mistakes. RCADS47Item30 @@ -2848,7 +2812,7 @@ clase. - es + es Me preocupo cuando estoy en la cama en la noche. RCADS47Item45_es @@ -2864,7 +2828,7 @@ clase. - en + en I feel worried when I think someone is angry with me. RCADS47Item8 @@ -2875,7 +2839,7 @@ clase. - es + es Me preocupa que algo terrible le vaya a pasar a alguien de mi familia. RCADS47Item13_25Item5_es @@ -2893,7 +2857,7 @@ mi familia. - en + en I feel scared when I have to take a test. RCADS47Item7 @@ -2908,7 +2872,7 @@ mi familia. - en + en I would feel afraid of being on my own at home. RCADS47Item5_25Item3 @@ -2923,7 +2887,7 @@ mi familia. - en + en I have trouble going to school in the mornings because I feel nervous or afraid. RCADS47Item18 @@ -2938,7 +2902,10 @@ mi familia. - en + + + + en Nothing is much fun anymore. RCADS47Item6_25Item4 @@ -2949,7 +2916,7 @@ mi familia. - es + es Me preocupa lo que los demás piensen de mi . RCADS47Item32_25Item7_es @@ -2961,7 +2928,7 @@ mi familia. - es + es Me siento como que no quiero moverme. RCADS47Item40_25Item19_es @@ -2977,7 +2944,7 @@ mi familia. - en + en I have problems with my appetite. RCADS47Item15_25Item10 @@ -2992,7 +2959,7 @@ mi familia. - en + en I have to do some things over and over again (like washing my hands, cleaning or putting things in a certain order). RCADS47Item42_25Item12 @@ -3008,7 +2975,7 @@ mi familia. - en + en I worry that I will do badly at my schoolwork. RCADS47Item12 @@ -3023,7 +2990,7 @@ mi familia. - en + en No mapping in SNOMED exists to detected symptom (worry about sleep/reluctance to sleep) I worry when I go to bed at night. RCADS47Item45 @@ -3039,7 +3006,7 @@ mi familia. - en + en I worry about what is going to happen. RCADS47Item35 @@ -3054,7 +3021,7 @@ mi familia. - en + en All of a sudden I feel really scared for no reason at all. RCADS47Item34 @@ -3065,7 +3032,7 @@ mi familia. - es + es Me preocupa que me vayan a ocurrir cosas malas. RCADS47Item22_es @@ -3081,7 +3048,7 @@ mi familia. - en + en I have to do some things in just the right way to stop bad things from happening. RCADS47Item44_25Item23 @@ -3096,7 +3063,7 @@ mi familia. - en + en I feel afraid if I have to talk in front of my class. RCADS47Item38 @@ -3111,7 +3078,7 @@ mi familia. - en + en I feel worthless. RCADS47Item29_25Item16 @@ -3122,7 +3089,7 @@ mi familia. - es + es Me preocupa de lo que vaya a pasar. RCADS47Item35_es @@ -3134,7 +3101,7 @@ mi familia. - es + es Me da miedo tener que estar solo/a en casa. RCADS47Item5_25Item3_es @@ -3146,7 +3113,7 @@ mi familia. - es + es Me preocupo cuando pienso que no hice algo bien. RCADS47Item4_25Item2_es @@ -3163,7 +3130,7 @@ mi familia. - en + en I worry I might look foolish. RCADS47Item20 @@ -3174,7 +3141,7 @@ mi familia. - es + es Me daría miedo si tuviera que pasar la noche fuera de casa. RCADS47Item46_es @@ -3186,7 +3153,7 @@ mi familia. - es + es Me molestan pensamientos malos o ridículos o imágenes en mi mente. RCADS47Item10_es @@ -3199,7 +3166,7 @@ mi mente. - es + es Ya nada me divierte mucho. RCADS47Item6_25Item4_es @@ -3215,7 +3182,7 @@ mi mente. - en + en I cannot think clearly. RCADS47Item25_25Item15 @@ -3230,7 +3197,7 @@ mi mente. - en + en When I have a problem, my heart beats really fast. RCADS47Item24 @@ -3241,7 +3208,7 @@ mi mente. - es + es Cuando tengo un problema, siento un malestar en el estómago. RCADS47Item3_es @@ -3253,7 +3220,7 @@ mi mente. - es + es No puedo pensar con claridad. RCADS47Item25_25Item15_es @@ -3269,7 +3236,7 @@ mi mente. - en + en I worry that something bad will happen to me. RCADS47Item27_25Item25 @@ -3284,7 +3251,7 @@ mi mente. - en + en I am afraid of being in crowded places (like shopping centers, the movies, buses, busy playgrounds). RCADS47Item33_25Item6 @@ -3299,7 +3266,7 @@ mi mente. - en + en I am tired a lot. RCADS47Item21_25Item21 @@ -3310,7 +3277,7 @@ mi mente. - es + es Me siento inquieto/a. RCADS47Item47_25Item24_es @@ -3326,7 +3293,7 @@ mi mente. - en + en I have trouble sleeping. RCADS47Item11_25Item8 @@ -3337,7 +3304,7 @@ mi mente. - es + es Me preocupo cuando pienso que alguien está enojado/a conmigo. RCADS47Item8_es @@ -3350,7 +3317,7 @@ conmigo. - es + es Tengo que verificar constantemente que haya hecho las cosas bien (como el apagar la luz, o que la puerta este cerrada con llave). @@ -3364,7 +3331,7 @@ cerrada con llave). - es + es Tengo que hacer ciertas cosas una y otra vez (como lavarme las manos, limpiar, o poner las cosas en cierto orden). RCADS47Item42_25Item12_es @@ -3381,7 +3348,7 @@ las manos, limpiar, o poner las cosas en cierto orden). - en + en I have to think of special thoughts (like numbers or words) to stop bad things from happening. RCADS47Item31_25Item17 @@ -3392,7 +3359,7 @@ las manos, limpiar, o poner las cosas en cierto orden). - es + es Me late el corazón muy rápido aun cuando no hay razón para sentirme así. RCADS47Item39_es @@ -3405,7 +3372,7 @@ para sentirme así. - es + es Me preocupo de que de repente vaya a sentir miedo aun cuando no hay razón para sentirme así. RCADS47Item41_25Item20_es @@ -3422,7 +3389,7 @@ cuando no hay razón para sentirme así. - en + en I have to keep checking that I have done things right (like the switch is off, or the door is locked). RCADS47Item16 @@ -3433,7 +3400,7 @@ cuando no hay razón para sentirme así. - es + es Me cuesta trabajo ir a la escuela por las mañanas porque me siento nervioso/a o con miedo. RCADS47Item18_es @@ -3446,7 +3413,7 @@ siento nervioso/a o con miedo. - es + es Tengo dificultades para dormir bien. RCADS47Item11_25Item8_es @@ -3458,7 +3425,7 @@ siento nervioso/a o con miedo. - es + es Me da miedo que vaya a hacer el ridículo en frente de las personas. RCADS47Item43_25Item22_es @@ -3475,7 +3442,7 @@ personas. - en + en I worry that bad things will happen to me. RCADS47Item22 @@ -3486,7 +3453,7 @@ personas. - es + es Me siento que no valgo nada. RCADS47Item29_25Item16_es @@ -3498,7 +3465,7 @@ personas. - es + es Tengo que hacer algunas cosas exactamente de la manera correcta para evitar que cosas malas sucedan. RCADS47Item44_25Item23_es @@ -3511,7 +3478,7 @@ correcta para evitar que cosas malas sucedan. - es + es Me siento de repente mareado/a o débil aun cuando no haya razón para sentirme así. RCADS47Item36_25Item11_es @@ -3524,7 +3491,7 @@ haya razón para sentirme así. - es + es Me siento triste o vacío/a. RCADS47Item2_25Item1_es diff --git a/POEM.rdf b/POEM.rdf index d9373cc..bea9b8d 100644 --- a/POEM.rdf +++ b/POEM.rdf @@ -33,7 +33,6 @@ - Kelsey Rook The Psychometric Ontology of Experience and Measures provides an ontology of domain concepts for the measurement of symptoms and syndromes related to psychiatric conditions. 2023-11-20 @@ -84,6 +83,33 @@ --> + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + @@ -340,20 +366,7 @@ /////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////// --> - - - - - - - - - - - - - - + From 2fc0bc6c2881bd989ca8f6c23d216e94a0965101 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: shmewtep Date: Mon, 22 Apr 2024 14:58:10 -0400 Subject: [PATCH 16/46] moved items from RCADS-47 questionnaire to appropriate scales --- POEM-RCADS.rdf | 187 ++++++++++++++++++++++++++----------------------- 1 file changed, 101 insertions(+), 86 deletions(-) diff --git a/POEM-RCADS.rdf b/POEM-RCADS.rdf index 63df47d..1d7294c 100644 --- a/POEM-RCADS.rdf +++ b/POEM-RCADS.rdf @@ -42,6 +42,19 @@ // /////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////// --> + + + + + + + + + + + + + @@ -55,7 +68,6 @@ - @@ -91,7 +103,6 @@ - @@ -100,29 +111,6 @@ - - - - - - - - - - - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + @@ -568,9 +640,6 @@ - - - @@ -598,6 +667,9 @@ + + + @@ -2117,53 +2189,6 @@ - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - @@ -3496,16 +3521,6 @@ haya razón para sentirme así. RCADS47Item2_25Item1_es - - - - From 4f000ec779c653ebcb8c30295d0108ce7a27a9c4 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: shmewtep Date: Fri, 10 May 2024 01:44:57 -0400 Subject: [PATCH 17/46] added RCADS47-P --- POEM-RCADS.rdf | 585 +++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ 1 file changed, 585 insertions(+) diff --git a/POEM-RCADS.rdf b/POEM-RCADS.rdf index 1d7294c..9d87944 100644 --- a/POEM-RCADS.rdf +++ b/POEM-RCADS.rdf @@ -674,6 +674,14 @@ + + + + + + + + @@ -2178,6 +2186,55 @@ + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + @@ -2193,6 +2250,64 @@ + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + @@ -2265,6 +2380,26 @@ + + + + + + My child has to do some things in just the right way to stop bad things from happening + + + + + + + + + + My child feels restless + + + + @@ -2335,6 +2470,26 @@ escuela. + + + + + + My child cannot think clearly + + + + + + + + + + My child worries about things + + + + @@ -2348,6 +2503,16 @@ razón alguna para sentirme así. + + + + + + My child’s heart suddenly starts to beat too quickly for no reason + + + + @@ -2372,6 +2537,26 @@ razón alguna para sentirme así. + + + + + + My child would feel scared if he/she had to stay away from home overnight + + + + + + + + + + My child feels afraid that he/she will make a fool of him/herself in front of people + + + + @@ -2528,6 +2713,16 @@ alguna razón para sentirme así. + + + + + + My child worries about making mistakes + + + + @@ -2570,6 +2765,16 @@ alguna razón para sentirme así. + + + + + + My child feels sad or empty + + + + @@ -2597,6 +2802,16 @@ alguna razón para sentirme así. + + + + + + My child has problems with his/her appetite + + + + @@ -2621,6 +2836,26 @@ alguna razón para sentirme así. + + + + + + Nothing is much fun for my child anymore + + + + + + + + + + My child worries about being away from me + + + + @@ -2634,6 +2869,36 @@ ridículos de la mente. + + + + + + My child worries when he/she thinks someone is angry with him/her + + + + + + + + + + My child has to keep checking that he/she has done things right (like the switch is off, or the door is locked) + + + + + + + + + + When my child has a problem, he/she feels shaky + + + + @@ -2665,6 +2930,16 @@ ridículos de la mente. + + + + + + My child is afraid of being in crowded places (like shopping centers, the movies, buses, busy playgrounds) + + + + @@ -2690,6 +2965,16 @@ razón. + + + + + + My child worries that something bad will happen to him/her + + + + @@ -2705,6 +2990,16 @@ razón. + + + + + + My child has to do some things over and over again (like washing hands, cleaning, or putting things in a certain order) + + + + @@ -2749,6 +3044,26 @@ autobuses, sitios de recreo llenos). + + + + + + My child worries what other people think of him/her + + + + + + + + + + My child feels afraid of being alone at home + + + + @@ -2768,6 +3083,16 @@ autobuses, sitios de recreo llenos). + + + + + + My child thinks about death + + + + @@ -2776,6 +3101,16 @@ autobuses, sitios de recreo llenos). + + + + + + My child worries about looking foolish + + + + @@ -2788,6 +3123,16 @@ autobuses, sitios de recreo llenos). + + + + + + My child feels scared when taking a test + + + + @@ -2804,6 +3149,16 @@ autobuses, sitios de recreo llenos). + + + + + + My child worries that he/she will suddenly get a scared feeling when there is nothing to be afraid of + + + + @@ -2845,6 +3200,36 @@ clase. + + + + + + My child can't seem to get bad or silly thoughts out of his/her head + + + + + + + + + + My child worries about what is going to happen + + + + + + + + + + My child worries when he/she thinks he/she has done poorly at something + + + + @@ -3007,6 +3392,16 @@ mi familia. + + + + + + When my child has a problem, his/her heart beats really fast + + + + @@ -3065,6 +3460,26 @@ mi familia. + + + + + + My child has trouble going to school in the mornings because of feeling nervous or afraid + + + + + + + + + + My child has to think of special thoughts (like numbers or words) to stop bad things from happening + + + + @@ -3080,6 +3495,26 @@ mi familia. + + + + + + My child suddenly starts to tremble or shake when there is no reason for this + + + + + + + + + + My child feels scared to sleep on his/her own + + + + @@ -3095,6 +3530,16 @@ mi familia. + + + + + + My child suddenly becomes dizzy or faint when there is no reason for this + + + + @@ -3122,6 +3567,16 @@ mi familia. + + + + + + My child worries about doing badly at school work + + + + @@ -3214,6 +3669,26 @@ mi mente. + + + + + + My child suddenly feels as if he/she can't breathe when there is no reason for this + + + + + + + + + + My child feels afraid if he/she has to talk in front of the class + + + + @@ -3229,6 +3704,16 @@ mi mente. + + + + + + My child is bothered by bad or silly thoughts or pictures in his/her mind + + + + @@ -3241,6 +3726,16 @@ mi mente. + + + + + + My child has trouble sleeping + + + + @@ -3268,6 +3763,16 @@ mi mente. + + + + + + My child feels worthless + + + + @@ -3406,6 +3911,26 @@ cuando no hay razón para sentirme así. + + + + + + My child feels like he/she doesn’t want to move + + + + + + + + + + All of a sudden my child will feel really scared for no reason at all + + + + @@ -3421,6 +3946,16 @@ cuando no hay razón para sentirme así. + + + + + + My child worries that something bad will happen to him/her + + + + @@ -3446,6 +3981,16 @@ siento nervioso/a o con miedo. + + + + + + My child worries that something awful will happen to someone in the family + + + + @@ -3459,6 +4004,16 @@ personas. + + + + + + My child has no energy for things + + + + @@ -3474,6 +4029,16 @@ personas. + + + + + + My child worries when in bed at night + + + + @@ -3486,6 +4051,26 @@ personas. + + + + + + My child is tired a lot + + + + + + + + + + When my child has a problem, he/she gets a funny feeling in his/her stomach + + + + From 7359b6f9b623a71af9ba8361630805d2495f5470 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: shmewtep Date: Fri, 10 May 2024 11:36:27 -0400 Subject: [PATCH 18/46] Added cohorts, statistics for Esbutani Full Study 1 --- POEM-RCADS.rdf | 227 +++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++---- 1 file changed, 209 insertions(+), 18 deletions(-) diff --git a/POEM-RCADS.rdf b/POEM-RCADS.rdf index 9d87944..924ae33 100644 --- a/POEM-RCADS.rdf +++ b/POEM-RCADS.rdf @@ -64,12 +64,24 @@ + + + + + + + + + + + + @@ -111,6 +123,26 @@ + + + + + + + + + + Cronbach's Alpha + + + + + + + + Esbutani Full Study1 + + + + + + + + + 967 + Esbutani Full Study1 Cohort (Caregiver) Count + + + + + + + + + + + Esbutani Full Study1 Cohort (Caregiver) + + + + + + + + + + + + + + + + + + 0.84 + Esbutani Full Study1 Cohort (Youth) SP alpha + + + + + + + + + + + + 0.71 + Esbutani Full Study1 Cohort (Youth) PD alpha + + + + + + + + + + + + 0.82 + Esbutani Full Study1 Cohort (Youth) GAD alpha + + + + + + + + + + + + 0.8 + Esbutani Full Study1 Cohort (Youth) MDD alpha + + + + + + + + + + + + 0.72 + Esbutani Full Study1 Cohort (Youth) SAD alpha + + + + + + + + + + + + 0.74 + Esbutani Full Study1 Cohort (Youth) OCD alpha + + + + + + + + + 967 + Esbutani Full Study1 Cohort (Youth) Count + + + + + + + + + + 18 + Esbutani Full Study1 Cohort (Youth) Max Age + + + + + + + + + + 8 + Esbutani Full Study1 Cohort (Youth) Min Age + + + + + + + + + + + + + Esbutani Full Study1 Cohort (Youth) + + + + From 46c744bbf6de75b615b94db085d2ef8d01e21379 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Kelsey Rook Date: Tue, 21 May 2024 15:00:34 -0400 Subject: [PATCH 19/46] Removed HAScO direct import; revised to reference only classes in use --- POEM.rdf | 189 ++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++--------------- 1 file changed, 140 insertions(+), 49 deletions(-) diff --git a/POEM.rdf b/POEM.rdf index bea9b8d..3f19643 100644 --- a/POEM.rdf +++ b/POEM.rdf @@ -3,6 +3,7 @@ xml:base="http://purl.org/twc/poem" xmlns:dc="http://purl.org/dc/elements/1.1/" xmlns:eco="http://purl.obolibrary.org/obo/eco.owl#" + xmlns:obo="http://purl.obolibrary.org/obo/" xmlns:owl="http://www.w3.org/2002/07/owl#" xmlns:rdf="http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#" xmlns:swa="http://topbraid.org/swa#" @@ -32,7 +33,6 @@ xmlns:elements1="http://purl.org/twc/poem.org/dc/elements/1.1/"> - Kelsey Rook The Psychometric Ontology of Experience and Measures provides an ontology of domain concepts for the measurement of symptoms and syndromes related to psychiatric conditions. 2023-11-20 @@ -54,6 +54,16 @@ + + + + The official definition, explaining the meaning of a class or property. Shall be Aristotelian, formalized and normalized. Can be augmented with colloquial definitions. + + definition + + + + @@ -83,33 +93,65 @@ --> - - + + + + + + - + - + + + + - + - + + + + - + - + + + + - + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + @@ -146,7 +188,7 @@ - + estimates condition @@ -181,7 +223,7 @@ - + has subscale @@ -222,7 +264,7 @@ - + is about condition @@ -288,7 +330,7 @@ - + is subject of scale @@ -298,7 +340,7 @@ - + is subscale of @@ -340,13 +382,13 @@ /////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////// --> + - - - - has language - + + + + @@ -366,7 +408,52 @@ /////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////// --> - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + A device which detects measurements, such as temperature or wind velocity + Detector + + + + + + + + + (Respondent) + Informant + + + + + + + + + A device or mechanism that is used to achire attribute values of entities of interest. An instrument does not necessarily require a way to store its measured quantity (e.g, a hard disk). + Instrument + + + @@ -377,16 +464,19 @@ - + - - questionnaire item + + + Questionnaire + + response option @@ -619,6 +709,7 @@ + A type of information that is used to support an assertion. evidence @@ -658,7 +749,7 @@ 1 - + composite scale @@ -705,6 +796,13 @@ + + + + + + + questionnaire scale a collection of indicators designed to be related to a shared construct @@ -731,7 +829,7 @@ - + @@ -744,22 +842,6 @@ - - - - - - - - 1 - - - - syndrome scale - - - - @@ -786,6 +868,12 @@ + + + + + + - + @@ -1086,7 +1174,7 @@ - + @@ -1095,7 +1183,7 @@ - + @@ -1104,7 +1192,7 @@ - + @@ -1113,7 +1201,7 @@ - + @@ -1122,7 +1210,7 @@ - + @@ -1150,6 +1238,9 @@ /////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////// --> + + has language + fear of death From dee746d9c2db20018a4ca994472f49026f41217b Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Kelsey Rook Date: Thu, 23 May 2024 23:57:36 -0400 Subject: [PATCH 20/46] added evidence class back in; made small fixes --- POEM.rdf | 79 +++++++++++++++++++++++++++++++++++++++----------------- 1 file changed, 55 insertions(+), 24 deletions(-) diff --git a/POEM.rdf b/POEM.rdf index 3f19643..0f227c7 100644 --- a/POEM.rdf +++ b/POEM.rdf @@ -54,6 +54,12 @@ + + + + + + @@ -64,6 +70,30 @@ + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + @@ -112,15 +142,6 @@ - - - - - - - - - @@ -130,15 +151,6 @@ - - - - - - - - - @@ -419,12 +431,6 @@ - - - - - - @@ -732,6 +738,31 @@ + + + + + is a population whose individual members realize (may be expressed as) a combination of inclusion rule values specifications or resulting from a sampling process (e.g. recruitment followed by randomization to group) on which a number of measurements will be carried out, which may be used as input to statistical tests and statistical inference. + Alejandra Gonzalez-Beltran + Orlaith Burke + Philippe Rocca-Serra + STATO + + statistical sample + study group population + + + + + + + + + cohort + + + + From 6aab93d2dac658514be639d51bbc9b5a268615dd Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Kelsey Rook Date: Fri, 24 May 2024 00:15:22 -0400 Subject: [PATCH 21/46] Added constraints on existing individuals connecting evidence & cohort --- POEM-RCADS.rdf | 323 +++++++++++++++++++++++++++---------------------- 1 file changed, 180 insertions(+), 143 deletions(-) diff --git a/POEM-RCADS.rdf b/POEM-RCADS.rdf index 924ae33..5ea18ff 100644 --- a/POEM-RCADS.rdf +++ b/POEM-RCADS.rdf @@ -2,6 +2,7 @@ + + + + + @@ -134,6 +141,18 @@ + + + + + + + + + + + + @@ -514,6 +533,7 @@ + 0.01 Chorpita Full Study 2 Age 6-12 SP p-value @@ -528,6 +548,7 @@ + 0.77 Chorpita Full Study 2 Age 6-12 SP r-value @@ -539,6 +560,7 @@ + 0.01 Chorpita Full Study 2 Age 6-12 PD p-value @@ -553,6 +575,7 @@ + 0.81 Chorpita Full Study 2 Age 6-12 PD r-value @@ -564,6 +587,7 @@ + 0.01 Chorpita Full Study 2 Age 6-12 GAD p-value @@ -578,6 +602,7 @@ + 0.84 Chorpita Full Study 2 Age 6-12 GAD r-value @@ -589,6 +614,7 @@ + 0.01 Chorpita Full Study 2 Age 6-12 MDD p-value @@ -603,6 +629,7 @@ + 0.71 Chorpita Full Study 2 Age 6-12 MDD r-value @@ -614,6 +641,7 @@ + 0.01 Chorpita Full Study 2 Age 6-12 SAD p-value @@ -628,6 +656,7 @@ + 0.76 Chorpita Full Study 2 Age 6-12 SAD r-value @@ -639,6 +668,7 @@ + 0.01 Chorpita Full Study 2 Age 6-12 OCD p-value @@ -653,6 +683,7 @@ + 0.66 Chorpita Full Study 2 Age 6-12 OCD r-value @@ -711,6 +742,7 @@ + 0.84 Esbutani Full Study1 Cohort (Youth) SP alpha @@ -724,6 +756,7 @@ + 0.71 Esbutani Full Study1 Cohort (Youth) PD alpha @@ -737,6 +770,7 @@ + 0.82 Esbutani Full Study1 Cohort (Youth) GAD alpha @@ -750,6 +784,7 @@ + 0.8 Esbutani Full Study1 Cohort (Youth) MDD alpha @@ -763,6 +798,7 @@ + 0.72 Esbutani Full Study1 Cohort (Youth) SAD alpha @@ -776,6 +812,7 @@ + 0.74 Esbutani Full Study1 Cohort (Youth) OCD alpha @@ -856,11 +893,11 @@ - - + + @@ -2520,7 +2557,7 @@ - + es Me da miedo cuando tengo un examen. RCADS47Item7_es @@ -2532,7 +2569,7 @@ - + @@ -2547,7 +2584,7 @@ - + es Tengo problemas con mi apetito. RCADS47Item15_25Item10_es @@ -2559,7 +2596,7 @@ - + @@ -2574,7 +2611,7 @@ - + My child has to do some things in just the right way to stop bad things from happening @@ -2584,7 +2621,7 @@ - + My child feels restless @@ -2594,7 +2631,7 @@ - + es Me preocupa que vaya a salir mal en mi trabajo de la escuela. @@ -2607,7 +2644,7 @@ escuela. - + @@ -2622,7 +2659,7 @@ escuela. - + @@ -2637,7 +2674,7 @@ escuela. - + @@ -2652,7 +2689,7 @@ escuela. - + es Me preocupo sobre las cosas. RCADS47Item1_es @@ -2664,7 +2701,7 @@ escuela. - + My child cannot think clearly @@ -2674,7 +2711,7 @@ escuela. - + My child worries about things @@ -2684,7 +2721,7 @@ escuela. - + es Comienzo a temblar o a estremecerme aun cuando no hay razón alguna para sentirme así. @@ -2697,7 +2734,7 @@ razón alguna para sentirme así. - + My child’s heart suddenly starts to beat too quickly for no reason @@ -2707,7 +2744,7 @@ razón alguna para sentirme así. - + es Me preocupa hacer el ridículo. RCADS47Item20_es @@ -2719,7 +2756,7 @@ razón alguna para sentirme así. - + es Me da miedo el dormir solo/a. RCADS47Item17_25Item9_es @@ -2731,7 +2768,7 @@ razón alguna para sentirme así. - + My child would feel scared if he/she had to stay away from home overnight @@ -2741,7 +2778,7 @@ razón alguna para sentirme así. - + My child feels afraid that he/she will make a fool of him/herself in front of people @@ -2751,7 +2788,7 @@ razón alguna para sentirme así. - + es Tengo que pensar en pensamientos especiales (como números o palabras) para evitar que sucedan cosas malas. @@ -2764,7 +2801,7 @@ números o palabras) para evitar que sucedan cosas malas. - + es De repente siento como si no pudiera respirar aun sin haber alguna razón para sentirme así. @@ -2777,7 +2814,7 @@ alguna razón para sentirme así. - + @@ -2792,7 +2829,7 @@ alguna razón para sentirme así. - + @@ -2808,7 +2845,7 @@ alguna razón para sentirme así. - + @@ -2823,7 +2860,7 @@ alguna razón para sentirme así. - + @@ -2838,7 +2875,7 @@ alguna razón para sentirme así. - + @@ -2853,7 +2890,7 @@ alguna razón para sentirme así. - + es No tengo energía para hacer las cosas. RCADS47Item19_25Item13_es @@ -2865,7 +2902,7 @@ alguna razón para sentirme así. - + @@ -2880,7 +2917,7 @@ alguna razón para sentirme así. - + @@ -2895,7 +2932,7 @@ alguna razón para sentirme así. - + es Estoy cansado/a con mucha frecuencia. RCADS47Item21_25Item21_es @@ -2907,7 +2944,7 @@ alguna razón para sentirme así. - + My child worries about making mistakes @@ -2917,7 +2954,7 @@ alguna razón para sentirme así. - + @@ -2932,7 +2969,7 @@ alguna razón para sentirme así. - + @@ -2947,7 +2984,7 @@ alguna razón para sentirme así. - + es Pienso acerca de la muerte. RCADS47Item37_25Item18_es @@ -2959,7 +2996,7 @@ alguna razón para sentirme así. - + My child feels sad or empty @@ -2969,7 +3006,7 @@ alguna razón para sentirme así. - + @@ -2984,7 +3021,7 @@ alguna razón para sentirme así. - + es Me preocupa de que algo malo me vaya a suceder. RCADS47Item27_25Item25_es @@ -2996,7 +3033,7 @@ alguna razón para sentirme así. - + My child has problems with his/her appetite @@ -3006,7 +3043,7 @@ alguna razón para sentirme así. - + es Cuando tengo algún problema, me siento tembloroso/a. RCADS47Item28_es @@ -3018,7 +3055,7 @@ alguna razón para sentirme así. - + es Me preocupa el estar alejado/a de mis padres. RCADS47Item9_es @@ -3030,7 +3067,7 @@ alguna razón para sentirme así. - + Nothing is much fun for my child anymore @@ -3040,7 +3077,7 @@ alguna razón para sentirme así. - + My child worries about being away from me @@ -3050,7 +3087,7 @@ alguna razón para sentirme así. - + es No parece que pueda quitarme los pensamientos malos o ridículos de la mente. @@ -3063,7 +3100,7 @@ ridículos de la mente. - + My child worries when he/she thinks someone is angry with him/her @@ -3073,7 +3110,7 @@ ridículos de la mente. - + My child has to keep checking that he/she has done things right (like the switch is off, or the door is locked) @@ -3083,7 +3120,7 @@ ridículos de la mente. - + When my child has a problem, he/she feels shaky @@ -3093,7 +3130,7 @@ ridículos de la mente. - + @@ -3108,7 +3145,7 @@ ridículos de la mente. - + @@ -3124,7 +3161,7 @@ ridículos de la mente. - + My child is afraid of being in crowded places (like shopping centers, the movies, buses, busy playgrounds) @@ -3134,7 +3171,7 @@ ridículos de la mente. - + es Me preocupa cometer errores. RCADS47Item30_es @@ -3146,7 +3183,7 @@ ridículos de la mente. - + es Me siento de repente con mucho miedo sin haber alguna razón. @@ -3159,7 +3196,7 @@ razón. - + My child worries that something bad will happen to him/her @@ -3169,7 +3206,7 @@ razón. - + @@ -3184,7 +3221,7 @@ razón. - + My child has to do some things over and over again (like washing hands, cleaning, or putting things in a certain order) @@ -3194,7 +3231,7 @@ razón. - + @@ -3209,7 +3246,7 @@ razón. - + @@ -3224,7 +3261,7 @@ razón. - + es Me da miedo estar en lugares concurridos (con mucha gente como en los centros comerciales, las películas, los @@ -3238,7 +3275,7 @@ autobuses, sitios de recreo llenos). - + My child worries what other people think of him/her @@ -3248,7 +3285,7 @@ autobuses, sitios de recreo llenos). - + My child feels afraid of being alone at home @@ -3258,7 +3295,7 @@ autobuses, sitios de recreo llenos). - + @@ -3277,7 +3314,7 @@ autobuses, sitios de recreo llenos). - + My child thinks about death @@ -3295,7 +3332,7 @@ autobuses, sitios de recreo llenos). - + My child worries about looking foolish @@ -3305,7 +3342,7 @@ autobuses, sitios de recreo llenos). - + es Cuando tengo algún problema, mi corazón late muy rápido. RCADS47Item24_es @@ -3317,7 +3354,7 @@ autobuses, sitios de recreo llenos). - + My child feels scared when taking a test @@ -3327,7 +3364,7 @@ autobuses, sitios de recreo llenos). - + @@ -3343,7 +3380,7 @@ autobuses, sitios de recreo llenos). - + My child worries that he/she will suddenly get a scared feeling when there is nothing to be afraid of @@ -3353,7 +3390,7 @@ autobuses, sitios de recreo llenos). - + es Me siento con miedo si tengo que hablar en frente de la clase. @@ -3366,7 +3403,7 @@ clase. - + @@ -3382,7 +3419,7 @@ clase. - + es Me preocupo cuando estoy en la cama en la noche. RCADS47Item45_es @@ -3394,7 +3431,7 @@ clase. - + My child can't seem to get bad or silly thoughts out of his/her head @@ -3404,7 +3441,7 @@ clase. - + My child worries about what is going to happen @@ -3414,7 +3451,7 @@ clase. - + My child worries when he/she thinks he/she has done poorly at something @@ -3424,7 +3461,7 @@ clase. - + @@ -3439,7 +3476,7 @@ clase. - + es Me preocupa que algo terrible le vaya a pasar a alguien de mi familia. @@ -3452,7 +3489,7 @@ mi familia. - + @@ -3468,7 +3505,7 @@ mi familia. - + @@ -3483,7 +3520,7 @@ mi familia. - + @@ -3498,7 +3535,7 @@ mi familia. - + @@ -3516,7 +3553,7 @@ mi familia. - + es Me preocupa lo que los demás piensen de mi . RCADS47Item32_25Item7_es @@ -3528,7 +3565,7 @@ mi familia. - + es Me siento como que no quiero moverme. RCADS47Item40_25Item19_es @@ -3540,7 +3577,7 @@ mi familia. - + @@ -3555,7 +3592,7 @@ mi familia. - + @@ -3570,7 +3607,7 @@ mi familia. - + @@ -3586,7 +3623,7 @@ mi familia. - + When my child has a problem, his/her heart beats really fast @@ -3596,7 +3633,7 @@ mi familia. - + @@ -3612,7 +3649,7 @@ mi familia. - + @@ -3627,7 +3664,7 @@ mi familia. - + @@ -3642,7 +3679,7 @@ mi familia. - + es Me preocupa que me vayan a ocurrir cosas malas. RCADS47Item22_es @@ -3654,7 +3691,7 @@ mi familia. - + My child has trouble going to school in the mornings because of feeling nervous or afraid @@ -3664,7 +3701,7 @@ mi familia. - + My child has to think of special thoughts (like numbers or words) to stop bad things from happening @@ -3674,7 +3711,7 @@ mi familia. - + @@ -3689,7 +3726,7 @@ mi familia. - + My child suddenly starts to tremble or shake when there is no reason for this @@ -3699,7 +3736,7 @@ mi familia. - + My child feels scared to sleep on his/her own @@ -3709,7 +3746,7 @@ mi familia. - + @@ -3724,7 +3761,7 @@ mi familia. - + My child suddenly becomes dizzy or faint when there is no reason for this @@ -3734,7 +3771,7 @@ mi familia. - + @@ -3749,7 +3786,7 @@ mi familia. - + es Me preocupa de lo que vaya a pasar. RCADS47Item35_es @@ -3761,7 +3798,7 @@ mi familia. - + My child worries about doing badly at school work @@ -3771,7 +3808,7 @@ mi familia. - + es Me da miedo tener que estar solo/a en casa. RCADS47Item5_25Item3_es @@ -3783,7 +3820,7 @@ mi familia. - + es Me preocupo cuando pienso que no hice algo bien. RCADS47Item4_25Item2_es @@ -3795,7 +3832,7 @@ mi familia. - + @@ -3811,7 +3848,7 @@ mi familia. - + es Me daría miedo si tuviera que pasar la noche fuera de casa. RCADS47Item46_es @@ -3823,7 +3860,7 @@ mi familia. - + es Me molestan pensamientos malos o ridículos o imágenes en mi mente. @@ -3836,7 +3873,7 @@ mi mente. - + es Ya nada me divierte mucho. RCADS47Item6_25Item4_es @@ -3848,7 +3885,7 @@ mi mente. - + @@ -3863,7 +3900,7 @@ mi mente. - + My child suddenly feels as if he/she can't breathe when there is no reason for this @@ -3873,7 +3910,7 @@ mi mente. - + My child feels afraid if he/she has to talk in front of the class @@ -3883,7 +3920,7 @@ mi mente. - + @@ -3898,7 +3935,7 @@ mi mente. - + My child is bothered by bad or silly thoughts or pictures in his/her mind @@ -3908,7 +3945,7 @@ mi mente. - + es Cuando tengo un problema, siento un malestar en el estómago. RCADS47Item3_es @@ -3920,7 +3957,7 @@ mi mente. - + My child has trouble sleeping @@ -3930,7 +3967,7 @@ mi mente. - + es No puedo pensar con claridad. RCADS47Item25_25Item15_es @@ -3942,7 +3979,7 @@ mi mente. - + @@ -3957,7 +3994,7 @@ mi mente. - + My child feels worthless @@ -3967,7 +4004,7 @@ mi mente. - + @@ -3982,7 +4019,7 @@ mi mente. - + @@ -3997,7 +4034,7 @@ mi mente. - + es Me siento inquieto/a. RCADS47Item47_25Item24_es @@ -4009,7 +4046,7 @@ mi mente. - + @@ -4024,7 +4061,7 @@ mi mente. - + es Me preocupo cuando pienso que alguien está enojado/a conmigo. @@ -4037,7 +4074,7 @@ conmigo. - + es Tengo que verificar constantemente que haya hecho las cosas bien (como el apagar la luz, o que la puerta este @@ -4051,7 +4088,7 @@ cerrada con llave). - + es Tengo que hacer ciertas cosas una y otra vez (como lavarme las manos, limpiar, o poner las cosas en cierto orden). @@ -4064,7 +4101,7 @@ las manos, limpiar, o poner las cosas en cierto orden). - + @@ -4079,7 +4116,7 @@ las manos, limpiar, o poner las cosas en cierto orden). - + es Me late el corazón muy rápido aun cuando no hay razón para sentirme así. @@ -4092,7 +4129,7 @@ para sentirme así. - + es Me preocupo de que de repente vaya a sentir miedo aun cuando no hay razón para sentirme así. @@ -4105,7 +4142,7 @@ cuando no hay razón para sentirme así. - + My child feels like he/she doesn’t want to move @@ -4115,7 +4152,7 @@ cuando no hay razón para sentirme así. - + All of a sudden my child will feel really scared for no reason at all @@ -4125,7 +4162,7 @@ cuando no hay razón para sentirme así. - + @@ -4140,7 +4177,7 @@ cuando no hay razón para sentirme así. - + My child worries that something bad will happen to him/her @@ -4150,7 +4187,7 @@ cuando no hay razón para sentirme así. - + es Me cuesta trabajo ir a la escuela por las mañanas porque me siento nervioso/a o con miedo. @@ -4163,7 +4200,7 @@ siento nervioso/a o con miedo. - + es Tengo dificultades para dormir bien. RCADS47Item11_25Item8_es @@ -4175,7 +4212,7 @@ siento nervioso/a o con miedo. - + My child worries that something awful will happen to someone in the family @@ -4185,7 +4222,7 @@ siento nervioso/a o con miedo. - + es Me da miedo que vaya a hacer el ridículo en frente de las personas. @@ -4198,7 +4235,7 @@ personas. - + My child has no energy for things @@ -4208,7 +4245,7 @@ personas. - + @@ -4223,7 +4260,7 @@ personas. - + My child worries when in bed at night @@ -4233,7 +4270,7 @@ personas. - + es Me siento que no valgo nada. RCADS47Item29_25Item16_es @@ -4245,7 +4282,7 @@ personas. - + My child is tired a lot @@ -4255,7 +4292,7 @@ personas. - + When my child has a problem, he/she gets a funny feeling in his/her stomach @@ -4265,7 +4302,7 @@ personas. - + es Tengo que hacer algunas cosas exactamente de la manera correcta para evitar que cosas malas sucedan. @@ -4278,7 +4315,7 @@ correcta para evitar que cosas malas sucedan. - + es Me siento de repente mareado/a o débil aun cuando no haya razón para sentirme así. @@ -4291,7 +4328,7 @@ haya razón para sentirme así. - + es Me siento triste o vacío/a. RCADS47Item2_25Item1_es From 92b41aa009abe5b7c4396cbbd6453a161aa7efa0 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Kelsey Rook Date: Tue, 4 Jun 2024 15:59:36 -0400 Subject: [PATCH 22/46] removed erroneous class xsd:String; removed object property hasco:hasLanguage (range: xsd:String) --- POEM.rdf | 18 +----------------- 1 file changed, 1 insertion(+), 17 deletions(-) diff --git a/POEM.rdf b/POEM.rdf index 0f227c7..0a53f57 100644 --- a/POEM.rdf +++ b/POEM.rdf @@ -125,14 +125,6 @@ - - - - - - - - @@ -758,6 +750,7 @@ + a cohort is a study group population where the members are human beings which meet inclusion criteria and undergo a longitudinal design cohort @@ -899,12 +892,6 @@ - - - - - - - - has language - fear of death From 7ea07cbcc8f1e3619ed5ec3ba0129d58807059dc Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Kelsey Rook Date: Tue, 4 Jun 2024 16:22:19 -0400 Subject: [PATCH 23/46] Fixed Construct/Disorder/Symptom hierarchy; removed Condition; fixed definition annotations incorrectly using rdfs:comment --- POEM.rdf | 78 +++++++++++++++++++++++++------------------------------- 1 file changed, 35 insertions(+), 43 deletions(-) diff --git a/POEM.rdf b/POEM.rdf index 0a53f57..a38ef8f 100644 --- a/POEM.rdf +++ b/POEM.rdf @@ -189,12 +189,12 @@ - + - + - - estimates condition + + estimates construct @@ -263,14 +263,14 @@ - + - + - - is about condition + + is about construct @@ -333,7 +333,7 @@ - + is subject of scale @@ -427,8 +427,8 @@ - A device which detects measurements, such as temperature or wind velocity Detector + A device which detects measurements, such as temperature or wind velocity @@ -437,8 +437,8 @@ - (Respondent) Informant + (Respondent) @@ -447,8 +447,8 @@ - A device or mechanism that is used to achire attribute values of entities of interest. An instrument does not necessarily require a way to store its measured quantity (e.g, a hard disk). Instrument + A device or mechanism that is used to achire attribute values of entities of interest. An instrument does not necessarily require a way to store its measured quantity (e.g, a hard disk). @@ -707,7 +707,7 @@ - A type of information that is used to support an assertion. + A type of information that is used to support an assertion. evidence @@ -781,19 +781,11 @@ - + - - - - - - 2 - - - - condition - an entity typically representing an elevation on a syndrome + + + construct @@ -801,7 +793,7 @@ - + disorder a disease entity typically representing a non-normative elevation on a syndrome in conjuction with marked distress or impairment @@ -823,8 +815,8 @@ - - + + questionnaire scale @@ -836,7 +828,7 @@ - + @@ -938,7 +930,7 @@ - + @@ -947,7 +939,7 @@ - + @@ -974,7 +966,7 @@ - + @@ -1048,7 +1040,7 @@ - + @@ -1083,7 +1075,7 @@ - + @@ -1100,7 +1092,7 @@ - + @@ -1167,7 +1159,7 @@ - + @@ -1176,7 +1168,7 @@ - + @@ -1193,7 +1185,7 @@ - + @@ -1202,7 +1194,7 @@ - + @@ -1211,7 +1203,7 @@ - + @@ -1220,7 +1212,7 @@ - + @@ -1229,7 +1221,7 @@ - + @@ -1243,7 +1235,7 @@ - + From e0f77135175ea374a3dc018d24c52e66d5651f33 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Kelsey Rook Date: Mon, 10 Jun 2024 18:29:52 -0400 Subject: [PATCH 24/46] added sparqlbook to track example/demo queries --- queries.sparqlbook | 20 ++++++++++++++++++++ 1 file changed, 20 insertions(+) create mode 100644 queries.sparqlbook diff --git a/queries.sparqlbook b/queries.sparqlbook new file mode 100644 index 0000000..ce0ff64 --- /dev/null +++ b/queries.sparqlbook @@ -0,0 +1,20 @@ +[ + { + "kind": 1, + "language": "markdown", + "value": "Is this measure reliable and valid enough to use in my study about children aged 6-12 with Major Depressive Disorder?", + "metadata": {} + }, + { + "kind": 2, + "language": "sparql", + "value": "PREFIX owl: \nPREFIX rdf: \nPREFIX rdfs: \nPREFIX hasco: \nPREFIX vstoi: \nPREFIX poem: \nPREFIX poem-rcads: \nPREFIX sio: \nPREFIX snomed: \nPREFIX eco: \n\nSELECT ?evidence (STR(?lab) AS ?label) WHERE {\n\t?evidence sio:SIO_000332 poem:RCADS47MajorDepressiveDisorderScale .\n ?evidence rdf:type eco:ECO_0000000 .\n}", + "metadata": {} + }, + { + "kind": 2, + "language": "sparql", + "value": "PREFIX owl: \nPREFIX rdf: \nPREFIX rdfs: \nPREFIX hasco: \nPREFIX vstoi: \nPREFIX poem: \nPREFIX poem-rcads: \nPREFIX sio: \nPREFIX snomed: \nPREFIX eco: \n\nSELECT ?evidence (STR(?lab) AS ?label) WHERE {\n ?evidence rdf:type eco:ECO_0000000 .\n}", + "metadata": {} + } +] \ No newline at end of file From b5fc50b3d8221f103bdf9a1e05a77019637080d9 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Kelsey Rook Date: Mon, 10 Jun 2024 18:34:31 -0400 Subject: [PATCH 25/46] Finalized query for CQ14: Is this measure reliable and valid enough...? --- queries.sparqlbook | 8 +------- 1 file changed, 1 insertion(+), 7 deletions(-) diff --git a/queries.sparqlbook b/queries.sparqlbook index ce0ff64..6b513c0 100644 --- a/queries.sparqlbook +++ b/queries.sparqlbook @@ -8,13 +8,7 @@ { "kind": 2, "language": "sparql", - "value": "PREFIX owl: \nPREFIX rdf: \nPREFIX rdfs: \nPREFIX hasco: \nPREFIX vstoi: \nPREFIX poem: \nPREFIX poem-rcads: \nPREFIX sio: \nPREFIX snomed: \nPREFIX eco: \n\nSELECT ?evidence (STR(?lab) AS ?label) WHERE {\n\t?evidence sio:SIO_000332 poem:RCADS47MajorDepressiveDisorderScale .\n ?evidence rdf:type eco:ECO_0000000 .\n}", - "metadata": {} - }, - { - "kind": 2, - "language": "sparql", - "value": "PREFIX owl: \nPREFIX rdf: \nPREFIX rdfs: \nPREFIX hasco: \nPREFIX vstoi: \nPREFIX poem: \nPREFIX poem-rcads: \nPREFIX sio: \nPREFIX snomed: \nPREFIX eco: \n\nSELECT ?evidence (STR(?lab) AS ?label) WHERE {\n ?evidence rdf:type eco:ECO_0000000 .\n}", + "value": "PREFIX owl: \nPREFIX rdf: \nPREFIX rdfs: \nPREFIX hasco: \nPREFIX vstoi: \nPREFIX poem: \nPREFIX poem-rcads: \nPREFIX sio: \nPREFIX snomed: \nPREFIX eco: \n\nSELECT ?evidence ?evidencevalue ?significance ?significancevalue (STR(?lab) AS ?label) WHERE {\n\t?evidence sio:SIO_000332 poem:RCADS47MajorDepressiveDisorderScale .\n ?evidence rdf:type eco:ECO_0000000 .\n ?evidence poem:isAboutSource ?cohort .\n ?cohort rdf:type hasco:Cohort .\n ?cohort sio:SIO_000008 ?maxage .\n ?cohort sio:SIO_000008 ?minage .\n ?maxage rdf:type sio:SIO_001013 . # is type: age\n ?maxage rdf:type sio:SIO_001114 . # is type: maximal value\n ?maxage sio:SIO_000300 ?maxagevalue .\n FILTER (?maxagevalue = 12) .\n ?minage rdf:type sio:SIO_001013 . # is type: age\n ?minage rdf:type sio:SIO_001113 . # is type: minimal value\n ?minage sio:SIO_000300 ?minagevalue .\n FILTER (?minagevalue = 6) .\n ?significance sio:SIO_000332 ?evidence .\n ?significance rdf:type eco:ECO_0000000 .\n ?evidence sio:SIO_000300 ?evidencevalue .\n ?significance sio:SIO_000300 ?significancevalue .\n}", "metadata": {} } ] \ No newline at end of file From fc179fcb9cda0fe4d3482b8eddc5ce00482fd2b0 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Kelsey Rook Date: Mon, 10 Jun 2024 18:50:03 -0400 Subject: [PATCH 26/46] Repaired cohort & study labels, attributes --- POEM-RCADS.rdf | 69 +++++++++++++++++--------------------------------- 1 file changed, 23 insertions(+), 46 deletions(-) diff --git a/POEM-RCADS.rdf b/POEM-RCADS.rdf index 5ea18ff..8244a78 100644 --- a/POEM-RCADS.rdf +++ b/POEM-RCADS.rdf @@ -53,6 +53,12 @@ + + + + + + @@ -450,33 +456,22 @@ - - - - - Chorpita Full Study 1 - - - - - + - + - Chorpita Full Study 2 + + Chorpita Full Study 1 - + - + - - - - Chorpita Study 2 + Chorpita Full Study 2 @@ -488,7 +483,7 @@ - + Chorpita Full Study 2 Age 6-12 Cohort @@ -534,8 +529,8 @@ - 0.01 + 0.01 Chorpita Full Study 2 Age 6-12 SP p-value @@ -561,8 +556,8 @@ - 0.01 + 0.01 Chorpita Full Study 2 Age 6-12 PD p-value @@ -588,8 +583,8 @@ - 0.01 + 0.01 Chorpita Full Study 2 Age 6-12 GAD p-value @@ -615,8 +610,8 @@ - 0.01 + 0.01 Chorpita Full Study 2 Age 6-12 MDD p-value @@ -627,9 +622,9 @@ - - - + + + 0.71 Chorpita Full Study 2 Age 6-12 MDD r-value @@ -642,8 +637,8 @@ - 0.01 + 0.01 Chorpita Full Study 2 Age 6-12 SAD p-value @@ -669,8 +664,8 @@ - 0.01 + 0.01 Chorpita Full Study 2 Age 6-12 OCD p-value @@ -2536,24 +2531,6 @@ - - - - - Chorpita Original Study 1 - - - - - - - - - Chorpita Original Study 2 - - - - From 799c2deb02d01b7190d4f34bc6d73a27e3340621 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Kelsey Rook Date: Mon, 10 Jun 2024 19:11:45 -0400 Subject: [PATCH 27/46] isAboutCondition -> isAboutDisorder --- POEM.rdf | 24 ++++++++++++------------ 1 file changed, 12 insertions(+), 12 deletions(-) diff --git a/POEM.rdf b/POEM.rdf index a38ef8f..246cd8a 100644 --- a/POEM.rdf +++ b/POEM.rdf @@ -263,14 +263,14 @@ - + - + - is about construct + is about disorder @@ -815,7 +815,7 @@ - + @@ -1159,7 +1159,7 @@ - + @@ -1168,7 +1168,7 @@ - + @@ -1185,7 +1185,7 @@ - + @@ -1194,7 +1194,7 @@ - + @@ -1203,7 +1203,7 @@ - + @@ -1212,7 +1212,7 @@ - + @@ -1221,7 +1221,7 @@ - + @@ -1235,7 +1235,7 @@ - + From c6bee46027ba80224d24b50b08daa54a726425d2 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Kelsey Rook Date: Mon, 10 Jun 2024 19:22:52 -0400 Subject: [PATCH 28/46] Removed object properties mistakenly redeclared as annotation properties --- POEM-RCADS.rdf | 45 ++++++++++----------------------------------- 1 file changed, 10 insertions(+), 35 deletions(-) diff --git a/POEM-RCADS.rdf b/POEM-RCADS.rdf index 8244a78..54d407a 100644 --- a/POEM-RCADS.rdf +++ b/POEM-RCADS.rdf @@ -43,31 +43,6 @@ // /////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////// --> - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - @@ -360,7 +335,7 @@ - + @@ -888,11 +863,11 @@ + + - - @@ -900,7 +875,7 @@ - + @@ -2422,7 +2397,7 @@ - + @@ -2436,7 +2411,7 @@ - + @@ -2453,7 +2428,7 @@ - + @@ -2496,7 +2471,7 @@ - + @@ -2513,7 +2488,7 @@ - + @@ -2526,7 +2501,7 @@ - + From 2d87425c7d38cf85a81da26d8c54507b2d6a894c Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Kelsey Rook Date: Mon, 10 Jun 2024 19:37:07 -0400 Subject: [PATCH 29/46] removed redeclared SIO properties --- POEM-RCADS.rdf | 27 +-------------------------- 1 file changed, 1 insertion(+), 26 deletions(-) diff --git a/POEM-RCADS.rdf b/POEM-RCADS.rdf index 54d407a..1da9e27 100644 --- a/POEM-RCADS.rdf +++ b/POEM-RCADS.rdf @@ -42,32 +42,7 @@ // Annotation properties // /////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////// - --> - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + --> From ec24fd2cedf2e4de30e53b3b0af3acddc4939de1 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Kelsey Rook Date: Tue, 11 Jun 2024 16:10:44 -0400 Subject: [PATCH 30/46] added respondent information to RCADS-47 --- POEM-RCADS.rdf | 49 ++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++--- 1 file changed, 46 insertions(+), 3 deletions(-) diff --git a/POEM-RCADS.rdf b/POEM-RCADS.rdf index 1da9e27..1546c37 100644 --- a/POEM-RCADS.rdf +++ b/POEM-RCADS.rdf @@ -42,7 +42,15 @@ // Annotation properties // /////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////// - --> + --> + + + + + + + + @@ -317,7 +325,8 @@ - + + @@ -328,7 +337,8 @@ - + + @@ -2412,6 +2422,8 @@ + + @@ -2419,6 +2431,7 @@ + en @@ -2436,6 +2449,16 @@ + + + + + es + + + + + @@ -3256,6 +3279,26 @@ autobuses, sitios de recreo llenos). + + + + + + 18 + + + + + + + + + + 8 + + + + From c45107ed2639d8f6648726f3f06ce808e5c5acc2 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Kelsey Rook Date: Tue, 11 Jun 2024 16:29:11 -0400 Subject: [PATCH 31/46] Added derivation between RCADS-47, RCADS-25 --- POEM-RCADS.rdf | 25 ++++++++++++++----------- 1 file changed, 14 insertions(+), 11 deletions(-) diff --git a/POEM-RCADS.rdf b/POEM-RCADS.rdf index 1546c37..d2b6801 100644 --- a/POEM-RCADS.rdf +++ b/POEM-RCADS.rdf @@ -407,15 +407,6 @@ - - - - - caregiver - - - - @@ -848,11 +839,12 @@ - + + @@ -2422,7 +2414,7 @@ - + @@ -2931,6 +2923,15 @@ alguna razón para sentirme así. + + + + + caregiver + + + + @@ -3275,6 +3276,8 @@ autobuses, sitios de recreo llenos). + + From 77baf758e86595297f47a69e93a64868182774b9 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Kelsey Rook Date: Tue, 9 Jul 2024 17:49:01 -0400 Subject: [PATCH 32/46] Added RCADS scale labels --- POEM.rdf | 10 ++++++++++ 1 file changed, 10 insertions(+) diff --git a/POEM.rdf b/POEM.rdf index 246cd8a..cbc771c 100644 --- a/POEM.rdf +++ b/POEM.rdf @@ -1160,6 +1160,7 @@ + RCADS-25 Anxiety Scale @@ -1169,6 +1170,7 @@ + RCADS-25 Depression Scale @@ -1177,6 +1179,8 @@ + + RCADS-47 Generalized Anxiety Scale @@ -1184,6 +1188,7 @@ + RCADS-47 Major Depressive Disorder Scale @@ -1193,6 +1198,7 @@ + RCADS-47 Obsessive Compulsive Disorder Scale @@ -1202,6 +1208,7 @@ + RCADS-47 Panic Disorder Scale @@ -1211,6 +1218,7 @@ + RCADS-47 Separation Anxiety Disorder Scale @@ -1220,6 +1228,7 @@ + RCADS-47 Social Anxiety Disorder Scale @@ -1229,6 +1238,7 @@ + RCADS-47 Total Anxiety Scale From 8afee483b1e9ba4864637b9c49fe63fca43ba635 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Kelsey Rook Date: Tue, 9 Jul 2024 18:51:48 -0400 Subject: [PATCH 33/46] Moved scales to POEM-RCADS.rdf; added scale labels --- POEM-RCADS.rdf | 342 +++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++---- POEM.rdf | 95 -------------- 2 files changed, 319 insertions(+), 118 deletions(-) diff --git a/POEM-RCADS.rdf b/POEM-RCADS.rdf index d2b6801..9c06d75 100644 --- a/POEM-RCADS.rdf +++ b/POEM-RCADS.rdf @@ -76,6 +76,12 @@ + + + + + + @@ -88,12 +94,107 @@ + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + @@ -126,6 +281,36 @@ + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - - anxiety disorder - + @@ -233,6 +440,12 @@ + + + + + + @@ -241,6 +454,24 @@ + + + + + + + + + + + + + + + + + + @@ -305,13 +536,53 @@ - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + RCADS-25 Anxiety Scale + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + RCADS-25 Depression Scale + - + + @@ -319,7 +590,8 @@ - + RCADS-47 Generalized Anxiety Scale + @@ -337,27 +609,33 @@ + + RCADS-47 Major Depressive Disorder Scale - + + - + + RCADS-47 Obsessive Compulsive Disorder Scale + - + + @@ -367,13 +645,16 @@ - + + RCADS-47 Panic Disorder Scale + - + + @@ -381,13 +662,16 @@ - + + RCADS-47 Separation Anxiety Disorder Scale + + @@ -397,13 +681,24 @@ + + RCADS-47 Social Anxiety Disorder Scale - + + + + + + + + + RCADS-47 Total Anxiety Scale + @@ -845,6 +1140,7 @@ + RCADS-25 Questionnaire @@ -853,6 +1149,7 @@ + RCADS-47 Generalized Anxiety Disorder Scale (Parent Version) @@ -2375,6 +2672,7 @@ + RCADS-47 Major Depressive Disorder Scale (Parent Version) @@ -2389,6 +2687,7 @@ + RCADS-47 Obsessive Compulsive Disorder Scale (Parent Version) @@ -2406,6 +2705,7 @@ + RCADS-47 Panic Disorder Scale (Parent Version) @@ -2424,6 +2724,7 @@ en + RCADS-47 Questionnaire @@ -2437,16 +2738,7 @@ - - - - - - - - - es - + RCADS-47 Questionnaire (Parent Version) @@ -2462,6 +2754,7 @@ + RCADS-47 Separation Anxiety Disorder Scale (Parent Version) @@ -2479,6 +2772,7 @@ + RCADS-47 Social Anxiety Disorder Scale (Parent Version) @@ -2492,6 +2786,7 @@ + RCADS-47 Total Anxiety Disorder Scale (Parent Version) @@ -3202,6 +3497,7 @@ razón. + en I worry about things. RCADS47Item1 diff --git a/POEM.rdf b/POEM.rdf index cbc771c..504dce9 100644 --- a/POEM.rdf +++ b/POEM.rdf @@ -1155,101 +1155,6 @@ - - - - - - RCADS-25 Anxiety Scale - - - - - - - - - - RCADS-25 Depression Scale - - - - - - - - - - RCADS-47 Generalized Anxiety Scale - - - - - - - - RCADS-47 Major Depressive Disorder Scale - - - - - - - - - - RCADS-47 Obsessive Compulsive Disorder Scale - - - - - - - - - - RCADS-47 Panic Disorder Scale - - - - - - - - - - RCADS-47 Separation Anxiety Disorder Scale - - - - - - - - - - RCADS-47 Social Anxiety Disorder Scale - - - - - - - - - - RCADS-47 Total Anxiety Scale - - - - - - - - - - - + + + item stem + + + + + + + + + + + + + + 1 + + + + + + + 1 + + + + + + + 1 + + + Questionnaire @@ -815,10 +881,24 @@ - + + + + + 1 + + + + + + + 1 + + + questionnaire scale a collection of indicators designed to be related to a shared construct From cb5934f3086837c5fb795bae5e80d387b2d3d907 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Kelsey Rook Date: Fri, 11 Oct 2024 22:07:05 -0400 Subject: [PATCH 35/46] Added axioms on symptom experience, codebook --- POEM.rdf | 41 ++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++- 1 file changed, 40 insertions(+), 1 deletion(-) diff --git a/POEM.rdf b/POEM.rdf index 32e1169..44317e5 100644 --- a/POEM.rdf +++ b/POEM.rdf @@ -419,6 +419,19 @@ + + + + + + + + + + 1 + + + @@ -488,6 +501,13 @@ + + + + 1 + + + item @@ -541,6 +561,19 @@ + + + + + + + + + + 1 + + + response option @@ -928,7 +961,13 @@ - + + + + + + + 1 From a04ec9cb1fd7ca975935119a355052e8627a0361 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Kelsey Rook Date: Fri, 11 Oct 2024 22:21:54 -0400 Subject: [PATCH 36/46] added SemanticVariable class; added axioms on SemanticVariable, ItemStem --- POEM.rdf | 52 ++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ 1 file changed, 52 insertions(+) diff --git a/POEM.rdf b/POEM.rdf index 44317e5..28134b6 100644 --- a/POEM.rdf +++ b/POEM.rdf @@ -253,6 +253,15 @@ + + + + + has variable + + + + @@ -360,6 +369,14 @@ + + + + is variable of + + + + @@ -415,6 +432,27 @@ + + + + + + + 1 + + + + + + + 1 + + + + + + + @@ -516,6 +554,20 @@ + + + + + + + + + + + 1 + + + item stem From c4c5944b1d414a89a70f0e657fa3e8ad03c8be2a Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Kelsey Rook Date: Fri, 11 Oct 2024 22:36:29 -0400 Subject: [PATCH 37/46] Added psychometric questionnaire axioms --- POEM.rdf | 6 ++++++ 1 file changed, 6 insertions(+) diff --git a/POEM.rdf b/POEM.rdf index 28134b6..ece067c 100644 --- a/POEM.rdf +++ b/POEM.rdf @@ -955,6 +955,12 @@ + + + + + + psychometric questionnaire From 74698d927cecba52776882cabada7e21ffa87179 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Kelsey Rook Date: Sun, 13 Oct 2024 18:51:54 -0400 Subject: [PATCH 38/46] Removed object properties used previous to SIO alignment --- POEM.rdf | 113 ++++++++++--------------------------------------------- 1 file changed, 20 insertions(+), 93 deletions(-) diff --git a/POEM.rdf b/POEM.rdf index ece067c..52aee76 100644 --- a/POEM.rdf +++ b/POEM.rdf @@ -125,15 +125,6 @@ - - - - - - - - - @@ -149,29 +140,9 @@ - - - - - - - - - - - - - - - can be experienced as - - - - - can respond to @@ -189,26 +160,6 @@ - - - - - - estimates construct - - - - - - - - - - has possible respondent - - - - @@ -221,6 +172,16 @@ + + + + + + has subject + + + + @@ -236,6 +197,7 @@ + has symptom @@ -243,16 +205,6 @@ - - - - - - has target - - - - @@ -262,16 +214,6 @@ - - - - - - indicates experience - - - - @@ -311,29 +253,20 @@ - - - - - is experience of - - - - - + - - - is indicated by + + + is scale in - + - - - is scale in + + + is subject of @@ -363,6 +296,7 @@ + is symptom of @@ -1000,13 +934,6 @@ - - - - 1 - - - symptom a type of behavior, emotion, or thought that is indicative of a syndrome (or a disorder, indirectly) From 7d897fb82e3b6f50ebc076ecb34b4df7f055b6a7 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Kelsey Rook Date: Thu, 7 Nov 2024 15:10:18 -0500 Subject: [PATCH 39/46] poem:SymptomExperience -> poem:Experience --- POEM.rdf | 6 +++--- 1 file changed, 3 insertions(+), 3 deletions(-) diff --git a/POEM.rdf b/POEM.rdf index 52aee76..6eeb5c3 100644 --- a/POEM.rdf +++ b/POEM.rdf @@ -550,7 +550,7 @@ - + @@ -940,9 +940,9 @@ - + - + From ffb76019f933daed235c5b849a2b19cfc6b91225 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Kelsey Rook Date: Fri, 13 Dec 2024 17:28:40 -0500 Subject: [PATCH 40/46] Update POEM.rdf added Instrument Family --- POEM.rdf | 9 +++++++++ 1 file changed, 9 insertions(+) diff --git a/POEM.rdf b/POEM.rdf index 6eeb5c3..0f64cd5 100644 --- a/POEM.rdf +++ b/POEM.rdf @@ -885,6 +885,15 @@ + + + + + instrument family + + + + From f51bb19f936c75340fd841915333590be0cbd7c7 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Kelsey Rook Date: Sun, 15 Dec 2024 18:53:48 -0500 Subject: [PATCH 41/46] Fixed dc namespace --- POEM.rdf | 2 +- 1 file changed, 1 insertion(+), 1 deletion(-) diff --git a/POEM.rdf b/POEM.rdf index 0f64cd5..537487c 100644 --- a/POEM.rdf +++ b/POEM.rdf @@ -1,7 +1,7 @@ Date: Mon, 16 Dec 2024 14:17:00 -0500 Subject: [PATCH 42/46] Update POEM.rdf instrumentFamily --> instrumentCollection --- POEM.rdf | 4 ++-- 1 file changed, 2 insertions(+), 2 deletions(-) diff --git a/POEM.rdf b/POEM.rdf index 537487c..55520b5 100644 --- a/POEM.rdf +++ b/POEM.rdf @@ -885,9 +885,9 @@ - + - + instrument family From aba112aaea788c499fb2794474aba77374642608 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Kelsey Rook Date: Mon, 6 Jan 2025 15:18:41 -0500 Subject: [PATCH 43/46] Update POEM.rdf Changed hash to slash in base IRI (poem# --> poem/) --- POEM.rdf | 278 +++++++++++++++++++++++++++---------------------------- 1 file changed, 139 insertions(+), 139 deletions(-) diff --git a/POEM.rdf b/POEM.rdf index 55520b5..69ed6f7 100644 --- a/POEM.rdf +++ b/POEM.rdf @@ -1,5 +1,5 @@ - + - + can respond to @@ -150,162 +150,162 @@ - + - - + + detects - + - + - - - + + + has scale - + - - - + + + has subject - + - + - - - + + + has subscale - + - + - - + + has symptom - + - - + + has variable - + - + - - - + + + is about disorder - + - + is about source - + - + is about target - + - + is detected by - + - + is scale in - + - - + + is subject of - + - + - - + + is subject of scale - + - + - - + + is subscale of - + - + - + is symptom of - + - + is variable of @@ -444,8 +444,8 @@ - - + + @@ -463,7 +463,7 @@ - + @@ -491,7 +491,7 @@ - + @@ -528,7 +528,7 @@ 1 - + @@ -550,7 +550,7 @@ - + @@ -568,7 +568,7 @@ - + @@ -576,7 +576,7 @@ - + @@ -584,7 +584,7 @@ - + @@ -592,7 +592,7 @@ - + @@ -600,7 +600,7 @@ - + @@ -608,7 +608,7 @@ - + @@ -616,7 +616,7 @@ - + @@ -624,7 +624,7 @@ - + @@ -632,7 +632,7 @@ - + @@ -640,7 +640,7 @@ - + @@ -648,7 +648,7 @@ - + @@ -656,7 +656,7 @@ - + @@ -664,7 +664,7 @@ - + @@ -672,7 +672,7 @@ - + @@ -680,7 +680,7 @@ - + @@ -688,7 +688,7 @@ - + @@ -696,7 +696,7 @@ - + @@ -704,7 +704,7 @@ - + @@ -712,7 +712,7 @@ - + @@ -720,7 +720,7 @@ - + @@ -728,7 +728,7 @@ - + @@ -736,7 +736,7 @@ - + @@ -744,7 +744,7 @@ - + @@ -752,7 +752,7 @@ - + @@ -760,7 +760,7 @@ - + @@ -768,7 +768,7 @@ - + @@ -776,7 +776,7 @@ - + @@ -784,7 +784,7 @@ - + @@ -850,15 +850,15 @@ - + - - + + - + 1 - + composite scale @@ -866,37 +866,37 @@ - + - + construct - + - - + + disorder a disease entity typically representing a non-normative elevation on a syndrome in conjuction with marked distress or impairment - + - + instrument family - + - + @@ -909,14 +909,14 @@ - + - + - + @@ -939,19 +939,19 @@ - + - - + + symptom a type of behavior, emotion, or thought that is indicative of a syndrome (or a disorder, indirectly) - + - + @@ -963,7 +963,7 @@ 1 - + symptom experience @@ -1011,7 +1011,7 @@ - + @@ -1019,7 +1019,7 @@ - + @@ -1027,7 +1027,7 @@ - + @@ -1035,7 +1035,7 @@ - + @@ -1043,7 +1043,7 @@ - + @@ -1052,7 +1052,7 @@ - + @@ -1079,7 +1079,7 @@ - + @@ -1089,7 +1089,7 @@ - + @@ -1097,7 +1097,7 @@ - + @@ -1105,7 +1105,7 @@ - + @@ -1113,7 +1113,7 @@ - + @@ -1121,7 +1121,7 @@ - + @@ -1129,7 +1129,7 @@ - + @@ -1137,7 +1137,7 @@ - + @@ -1145,7 +1145,7 @@ - + @@ -1153,7 +1153,7 @@ - + @@ -1164,7 +1164,7 @@ - + @@ -1188,7 +1188,7 @@ - + @@ -1205,7 +1205,7 @@ - + @@ -1215,7 +1215,7 @@ - + @@ -1223,7 +1223,7 @@ - + @@ -1231,7 +1231,7 @@ - + @@ -1239,7 +1239,7 @@ - + @@ -1247,7 +1247,7 @@ - + @@ -1255,7 +1255,7 @@ - + @@ -1263,7 +1263,7 @@ - + From a529c89e09fabc87f068546fcc4c7b1efe968982 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Kelsey Rook Date: Mon, 6 Jan 2025 15:28:34 -0500 Subject: [PATCH 44/46] Update POEM.rdf Replaced vstoi URI with purl URI --- POEM.rdf | 80 ++++++++++++++++++++++++++++---------------------------- 1 file changed, 40 insertions(+), 40 deletions(-) diff --git a/POEM.rdf b/POEM.rdf index 69ed6f7..7891a2a 100644 --- a/POEM.rdf +++ b/POEM.rdf @@ -23,7 +23,7 @@ xmlns:shacl="http://www.w3.org/ns/shacl#" xmlns:stato="http://purl.obolibrary.org/obo/stato.owl#" xmlns:terms="http://purl.org/dc/terms/" - xmlns:vstoi="http://hadatac.org/ont/vstoi#" + xmlns:vstoi="http://purl.org/twc/vstoi/" xmlns:schema="http://schema.org/" xmlns:protege="http://protege.stanford.edu/plugins/owl/protege#" xmlns:elements="http://purl.org/ontology/POEM.org/dc/elements/1.1/" @@ -125,18 +125,18 @@ - + - - - + + + - + - + @@ -144,7 +144,7 @@ - + can respond to @@ -154,7 +154,7 @@ - + detects @@ -247,7 +247,7 @@ - + is detected by @@ -387,30 +387,30 @@ - + - + - + 1 - + - + - + Detector A device which detects measurements, such as temperature or wind velocity @@ -418,9 +418,9 @@ - + - + Informant (Respondent) @@ -428,9 +428,9 @@ - + - + Instrument A device or mechanism that is used to achire attribute values of entities of interest. An instrument does not necessarily require a way to store its measured quantity (e.g, a hard disk). @@ -438,10 +438,10 @@ - + - - + + @@ -457,7 +457,7 @@ - + @@ -470,14 +470,14 @@ 1 - + 1 - + item @@ -485,9 +485,9 @@ - + - + @@ -499,7 +499,7 @@ 1 - + item stem @@ -507,21 +507,21 @@ - + - - + + - + 1 - + @@ -543,9 +543,9 @@ - + - + @@ -557,7 +557,7 @@ 1 - + response option @@ -897,7 +897,7 @@ - + @@ -923,14 +923,14 @@ 1 - + 1 - + questionnaire scale From 6b14b80c11d9ea89b4f3110087b4ecce01b69dfd Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Kelsey Rook Date: Mon, 6 Jan 2025 15:35:07 -0500 Subject: [PATCH 45/46] Fixed label: 'instrument family' -> 'instrument collection' --- POEM.rdf | 2 +- 1 file changed, 1 insertion(+), 1 deletion(-) diff --git a/POEM.rdf b/POEM.rdf index 7891a2a..51c84d0 100644 --- a/POEM.rdf +++ b/POEM.rdf @@ -889,7 +889,7 @@ - instrument family + instrument collection From 852ba6f0651923c3473248ab8999e6162b2548df Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Kelsey Rook Date: Tue, 7 Jan 2025 13:32:19 -0500 Subject: [PATCH 46/46] Added ItemStemConcept class and related axioms --- POEM.rdf | 433 +++++++++++++++++++++++++++++-------------------------- 1 file changed, 228 insertions(+), 205 deletions(-) diff --git a/POEM.rdf b/POEM.rdf index 51c84d0..dc41a06 100644 --- a/POEM.rdf +++ b/POEM.rdf @@ -1,7 +1,7 @@ - Kelsey Rook + Kelsey Rook The Psychometric Ontology of Experience and Measures provides an ontology of domain concepts for the measurement of symptoms and syndromes related to psychiatric conditions. 2023-11-20 Psychometric Ontology of Experience and Measures @@ -125,21 +125,6 @@ - - - - - - - - - - - - - - - @@ -311,6 +296,21 @@ + + + + + + + + + + + + + + + @@ -387,184 +387,6 @@ - - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - - - - - - - - - Detector - A device which detects measurements, such as temperature or wind velocity - - - - - - - - - Informant - (Respondent) - - - - - - - - - Instrument - A device or mechanism that is used to achire attribute values of entities of interest. An instrument does not necessarily require a way to store its measured quantity (e.g, a hard disk). - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - - - - 1 - - - - item - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - item stem - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - - - - 1 - - - - - - - 1 - - - - Questionnaire - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - response option - - - - @@ -850,6 +672,28 @@ + + + + + + + + + + + + + + 1 + + + + item stem concept + + + + @@ -885,13 +729,35 @@ + + + + + + + + + + + + + + 1 + + + + symptom experience + + + + instrument collection - + @@ -923,7 +789,7 @@ 1 - + @@ -949,24 +815,181 @@ - + - - + + - + - + + 1 + + + + + + + + + + + + Detector + A device which detects measurements, such as temperature or wind velocity + + + + + + + + + Informant + (Respondent) + + + + + + + + + Instrument + A device or mechanism that is used to achire attribute values of entities of interest. An instrument does not necessarily require a way to store its measured quantity (e.g, a hard disk). + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 1 + + + + + + 1 - + - symptom experience + item + + + + + + + + + + + + 1 + + + + + + + 1 + + + + item stem + + + + + + + + + + + + + + + + + + 1 + + + + + + + 1 + + + + + + + 1 + + + + Questionnaire + + + + + + + + + + + + + + + + + + 1 + + + + response option