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thippo/Bioinformatics_Python_Modules

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##Author:  thippo
###E-mail: thippo@163.com
###Github: https://github.com/thippo
###Blog: http://thippo.github.io/

  • get_fasta_dict #处理fasta格式文件
  • multiple_replace #对一个字符串的多个字符同时做替换
  • analyse_interposcan_result #分析interproscan后的文件
  • get_web_content #获取网页源文件,就是模仿浏览器的爬虫
  • find_gene_position #查找指定区域是否在基因内以及上下游的基因
  • heatmap #用matplotlib以DataFrame画热基图
  • figure_to_array #将图片转换成一个三维数组
  • send_email.py #用python发邮件
  • figure_segmentation #图片切割
  • getORF #最长开放阅读框
  • repeats_sequence #指定长度序列的重复个数
  • denoise #将矩阵中零散的点清除
  • stack_count #计算矩阵中非1点的堆数(上下相连)
  • cosine #计算夹角余弦
  • multiprocessing_multithreading #多进程多线程简单用法
  • mymkdir #新建文件夹,如已存在可选择是否删除原文件夹
  • dict_order #字典键值排序
  • ProgressBar #进度条
  • domain_to_ip #域名转IP
  • ip_information #获取IP地址的详细信息
  • link_cluster #连接对聚类
  • youdao_tanslate_api #有道翻译API
  • PrintColor #linux输出带颜色的字体
  • Endput #最后一行不换行
  • WaveSteam #音频流
  • NonlinearRegression #非线性回归拟合
  • ndarray_recursion #多维数组转成字符串
  • reverse_strand #DNA互补链
  • sizeof_fmt #格式化文件大小
  • kzz #可转债

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An open source bioinformatics modules in python written by members of CNU-Bioinformatics-Laboratory

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